RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 SIN3BO75182 1162 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 LRCH4O75427 683 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 MIPP30301 263 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 MAPKAPK2P49137 400 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 PMS2CLQ68D20 193 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 ZNF783Q6ZMS7 281 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 NLRP14Q86W24 1093 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 TC2NQ8N9U0 490 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 DCAF4L2Q8NA75 395 aa18.49■□□□□ 0.55
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HERC3-205ENST00000426683 LOXL4Q96JB6 756 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 BTBD6Q96KE9 485 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 PEBP4Q96S96 227 aa18.49■□□□□ 0.55
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HERC3-205ENST00000426683 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 PACSIN1Q9BY11 444 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 RETREG1Q9H6L5 497 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 FBRSQ9HAH7 460 aa18.49■□□□□ 0.55
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HERC3-205ENST00000426683 ANAPC7Q9UJX3 599 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 AP4E1Q9UPM8 1137 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 VPS13AQ96RL7 3174 aa18.49■□□□□ 0.55
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HERC3-205ENST00000426683 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa18.48■□□□□ 0.55
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HERC3-205ENST00000426683 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
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HERC3-205ENST00000426683 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 SPON2Q9BUD6 331 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
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HERC3-205ENST00000426683 IP6K2Q9UHH9 426 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 VPS51Q9UID3 782 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 EML5Q05BV3 1969 aa18.48■□□□□ 0.55
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HERC3-205ENST00000426683 C9orf64Q5T6V5 341 aa18.47■□□□□ 0.55
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HERC3-205ENST00000426683 SLC36A4Q6YBV0 504 aa18.47■□□□□ 0.55
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HERC3-205ENST00000426683 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
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HERC3-205ENST00000426683 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa18.47■□□□□ 0.55
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HERC3-205ENST00000426683 SH2D3CQ8N5H7 860 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 NIPA2Q8N8Q9 360 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 ATP11CQ8NB49 1132 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 FRS2Q8WU20 508 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 UVRAGQ9P2Y5 699 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 HS3ST2Q9Y278 367 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 USP34Q70CQ2 3546 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-205ENST00000426683 CKAP5Q14008 2032 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC3-205ENST00000426683 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HERC3-205ENST00000426683 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
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