RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 HSPA4LO95757 839 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 TKTP29401 623 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPINB6P35237 376 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 GLUD2P49448 558 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 PDK1Q15118 436 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 SFT2D3Q587I9 215 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 NAPRTQ6XQN6 538 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CPNE1Q99829 537 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX25Q9H3E2 840 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM96AQ9H5X1 160 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 MYCP01106 439 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ACADSBP45954 432 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 IRF9Q00978 393 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXO47Q5MNV8 452 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 GRTP1Q5TC63 336 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 PIGZQ86VD9 579 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 WNT8BQ93098 351 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF39Q9H2S5 420 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAMTS10Q9H324 1103 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ACSS2Q9NR19 701 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 POMPQ9Y244 141 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB14O43829 449 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR32O75388 356 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 SCNN1AP37088 669 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 DEUP1Q05D60 604 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 SPANXN3Q5MJ09 141 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 PDSS2Q86YH6 399 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 GALNT15Q8N3T1 639 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 MOCOSQ96EN8 888 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 RBBP8Q99708 897 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 DERAQ9Y315 318 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 M0QYT0 321 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 RECQL4O94761 1208 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 MYL4P12829 197 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CALRP27797 417 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 PEX2P28328 305 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC153Q494R4 210 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 FSTL4Q6MZW2 842 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC27A1Q6PCB7 646 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CRYBG2Q8N1P7 616 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAAF3Q8N9W5 541 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 HSFY1Q96LI6 401 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 PACSIN3Q9UKS6 424 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 KPNA7A9QM74 516 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 COX4I1P13073 169 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFV1P49821 464 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 MAPK15Q8TD08 544 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 GDPD5Q8WTR4 605 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R36Q96LQ0 422 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 MEIS3P2A8K0S8 358 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CLDN5O00501 218 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 SPRP35270 261 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL34P49207 117 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPINB8P50452 374 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 AQP4P55087 323 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 SYPL2Q5VXT5 272 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CDH19Q9H159 772 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 COL1A2P08123 1366 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A096LPK6 155 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CD1EP15812 388 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 RAG1P15918 1043 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 BTKQ06187 659 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL4Q9C0H6 718 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC40Q9H9A6 602 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 IGSF9Q9P2J2 1179 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 VANGL2Q9ULK5 521 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CDY2AQ9Y6F7 541 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CDY1Q9Y6F8 540 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA8OA6NCC3 632 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA8NF8WBI6 632 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP9BO43861 1147 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 LIMK2P53671 638 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIP10Q15642 601 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 EPGNQ6UW88 154 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF410Q86VK4 478 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXW8Q8N3Y1 598 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAM32Q8TC27 787 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 MFSD3Q96ES6 412 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 OR52B2Q96RD2 323 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 APOL2Q9BQE5 337 aa19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms