RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-209	ENST00000415046		A1L4Q6	167 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	PLA2G6	O60733	806 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	SLC25A27	O95847	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	ICAM1	P05362	532 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	CALM1	P0DP23	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	CALM2	P0DP24	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	CALM3	P0DP25	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	KIF5B	P33176	963 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	COPB2	P35606	906 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	LIFR	P42702	1097 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	OAZ1	P54368	228 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	PRMT2	P55345	433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	CNTN2	Q02246	1040 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	TROAP	Q12815	778 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	E2F2	Q14209	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	GRB14	Q14449	540 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	CCDC157	Q569K6	752 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	RUFY3	Q7L099	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	TRIB2	Q92519	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046		H7C1Q1	480 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	ZBTB5	O15062	677 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	CYTH3	O43739	400 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	CCL5	P13501	91 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	CALML3	P27482	149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	KCNJ5	P48544	419 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	AK2	P54819	239 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	TPTE	P56180	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	UBXN2A	P68543	259 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	GTF2H3	Q13889	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046		Q6ZWC4	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	USP6NL	Q92738	828 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	GBF1	Q92538	1859 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	ABCB11	O95342	1321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	CPLX1	O14810	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	KCNAB3	O43448	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	STRN	O43815	780 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	LARGE1	O95461	756 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	BMP15	O95972	392 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	ALDH2	P05091	517 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-209	ENST00000415046	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.7 ms