RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 PM20D1Q6GTS8 502 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 TTC27Q6P3X3 843 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 PCGF5Q86SE9 256 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 LONP2Q86WA8 852 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCDC105Q8IYK2 499 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 ANKRD42Q8N9B4 389 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 PPFIBP2Q8ND30 876 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 MGARPQ8TDB4 240 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 LZICQ8WZA0 190 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 SNF8Q96H20 258 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 EPAS1Q99814 870 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF670Q9BS34 389 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 B3GNT5Q9BYG0 378 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 DPEP3Q9H4B8 488 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 ABCC13Q9NSE7 274 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 NMRK1Q9NWW6 199 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 EURLQ9NYK6 297 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 WNT16Q9UBV4 365 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 CHKBQ9Y259 395 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 BACE2Q9Y5Z0 518 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLUHO75153 1309 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 CREB3O43889 395 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 GFRA3O60609 400 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRCH4O75427 683 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 PDHA1P08559 390 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 TGM2P21980 687 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 STIP1P31948 543 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 TKTL1P51854 596 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 SNX1Q13596 522 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 PTK6Q13882 451 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPARCL1Q14515 664 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 RASA2Q15283 850 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 CTXN3Q4LDR2 81 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 TPGS2Q68CL5 300 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 RTL10Q7L3V2 364 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 TAS1R1Q7RTX1 841 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 TDRPQ86YL5 185 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMEM105Q8N8V8 129 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 KRT35Q92764 455 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 PTPRN2Q92932 1015 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPATA17Q96L03 361 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLITRK1Q96PX8 696 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 TTPALQ9BTX7 342 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 CXCL16Q9H2A7 254 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 RETREG1Q9H6L5 497 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 CRTAC1Q9NQ79 661 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF212Q9UDV6 495 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 CYTH4Q9UIA0 394 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMCO1Q9UM00 188 aa10.23□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 F8VP50 259 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 H0Y858 1186 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 TGM5O43548 720 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 EDF1O60869 148 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 ASMTLO95671 621 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 IMPDH2P12268 514 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 LCP1P13796 627 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 GM2AP17900 193 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 AOC1P19801 751 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 KDELR1P24390 212 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 MIPP30301 263 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARL4AP40617 200 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 PPP3CCP48454 512 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 TUBP50607 506 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAP3K7CLP57077 242 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPR17Q13304 367 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 ORC1Q13415 861 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 KRT81Q14533 505 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCDC6Q16204 474 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 TAZQ16635 292 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 PDK4Q16654 411 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 DNAAF5Q86Y56 855 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 SCUBE3Q8IX30 993 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF276Q8N554 614 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 C3orf58Q8NDZ4 430 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 PDZD8Q8NEN9 1154 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 FLCNQ8NFG4 579 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 MIPOL1Q8TD10 442 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 OVCA2Q8WZ82 227 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 GATA6Q92908 595 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 NT5C3BQ969T7 300 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 MYLPFQ96A32 169 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 NTAN1Q96AB6 310 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM149B1Q96BN6 582 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 BTBD6Q96KE9 485 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 OLFM3Q96PB7 478 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 GBP5Q96PP8 586 aa10.22□□□□□ -0.77
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC2A13Q96QE2 648 aa10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms