RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa7.89□□□□□ -1.15
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 TPRP12270 2363 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
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SGMS1-201ENST00000361543 TTC34A8MYJ7 566 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 I6L893 689 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP33O14559 1287 aa7.88□□□□□ -1.15
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SGMS1-201ENST00000361543 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF683Q8IZ20 524 aa7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 STK40Q8N2I9 435 aa7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 HDDC3Q8N4P3 179 aa7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 MINDY1Q8N5J2 469 aa7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 OR52K2Q8NGK3 314 aa7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 JOSD2Q8TAC2 188 aa7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 GANCQ8TET4 914 aa7.87□□□□□ -1.15
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