RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 PHACTR1Q9C0D0 580 aa24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP7B1O75881 506 aa24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 S100A3P33764 101 aa24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 EPHB3P54753 998 aa24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 FCGRTP55899 365 aa24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM159Q96B96 161 aa24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP13A1Q9HD20 1204 aa24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 HOXA2O43364 376 aa24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 PCYOX1Q9UHG3 505 aa24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 SALL1Q9NSC2 1324 aa24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM150BA6NC51 233 aa24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 USP12O75317 370 aa24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 NFICP08651 508 aa24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF621Q6ZSS3 439 aa24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 FNIP1Q8TF40 1166 aa24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.55■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A0B4J269 797 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD63C9JTQ0 380 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 E5RJQ4 531 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 PLCL1Q15111 1095 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ATAD3BQ5T9A4 648 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 OVOS1Q6IE37 1185 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC2A14Q8TDB8 520 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 LRMDAQ9H2I8 198 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 RAD21L1Q9H4I0 556 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO44Q9H4M3 255 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 USP20Q9Y2K6 914 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP1A2P05177 515 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC130P13994 396 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 HPCAL1P37235 193 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 CLK2P49760 499 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNJ2P63252 427 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 STX4Q12846 297 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 REPS1Q96D71 796 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 VAT1Q99536 393 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ASB7Q9H672 318 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 OR56A5P0C7T3 313 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJB2P25686 324 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 PDK3Q15120 406 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 NPNTQ6UXI9 565 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ADHFE1Q8IWW8 467 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINB11Q96P15 392 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 COX4I1P13073 169 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 INSRRP14616 1297 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR15P49685 360 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSWIM7Q19AV6 140 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 MREGQ8N565 214 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 VMP1Q96GC9 406 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 SETD4Q9NVD3 440 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 CRYL1Q9Y2S2 319 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 IL6P05231 212 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 SHMT1P34896 483 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 GRIK4Q16099 956 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 LIASO43766 372 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPAN3O60637 253 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 DGCR6Q14129 220 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO30Q8TB52 745 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 MBOAT7Q96N66 472 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 REEP1Q9H902 201 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 GGA2Q9UJY4 613 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC27Q6P3X3 843 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 GPSM1Q86YR5 675 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 IPPQ9Y573 584 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC10BA6NIK2 292 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKCIP41743 596 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 MAMLD1Q13495 774 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 SQLEQ14534 574 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 CDC73Q6P1J9 531 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 SYT12Q8IV01 421 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXW8Q8N3Y1 598 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPAN14Q8NG11 270 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 MCOLN3Q8TDD5 553 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 DLG4P78352 724 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ZPBP2Q6X784 338 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ALLCQ8N6M5 410 aa24.53■■□□□ 1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ART4Q93070 314 aa24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms