RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000202170.3

Pds5b-208, Transcript of Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Pds5b, Length 6,598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Bhlhe22Q8C6A8 355 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 RybpQ8CCI5 228 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ifnl3Q8CGK6 193 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Cd36Q08857 472 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Fnip1Q68FD7 1165 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Podnl1Q6P3Y9 559 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Spdye4bQ8CDE8 236 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Plbd1Q8VCI0 550 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 CenpnQ9CZW2 337 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Adck1Q9D0L4 525 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Dnaja4Q9JMC3 397 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Lgr4A2ARI4 951 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Nek2O35942 443 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Sox10Q04888 466 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Pyroxd1Q3TMV7 498 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ntrk1Q3UFB7 799 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 NkrfQ8BY02 690 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Hist1h2aaQ8CGP4 129 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Mgat5Q8R4G6 740 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ifrd2Q9D8U0 441 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Bscl2Q9Z2E9 383 aa15.96■□□□□ 0.15
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Aldh3a1P47739 453 aa15.96■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Serpinb5P70124 375 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Magee2Q52KG3 523 aa15.96■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gstt2Q61133 244 aa15.96■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gpsm1Q6IR34 673 aa15.96■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Prkag3Q8BGM7 489 aa15.96■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr1352Q8VGX5 309 aa15.96■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Dqx1Q924H9 718 aa15.96■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 CercamA3KGW5 592 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Serac1Q3U213 654 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 PapolgQ6PCL9 739 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Nipal1Q8BMW7 416 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Prl7b1Q8CGZ9 251 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 MutyhQ99P21 515 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Lrrc40Q9CRC8 602 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Scnn1bQ9WU38 638 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Katna1Q9WV86 491 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm7145A0A087WS64 360 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Zc3h7aE9PWW6 970 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Klrb1Q0ZUP1 214 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Pdss1Q33DR2 409 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Lrrc27Q80YS5 523 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Use1Q9CQ56 270 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rec114Q9CWH4 259 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ddx28Q9CWT6 540 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Axin1O35625 863 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Kcnu1O54982 1121 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Zfp953Q3UPV7 304 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Smarcd1Q61466 515 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Fgd2Q8BY35 655 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Arhgap25Q8BYW1 648 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Pcyox1lQ8C7K6 495 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Washc1Q8VDD8 475 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 4930513O06RikQ9D549 161 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Glt6d1Q2NKH9 311 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Nfe2l1Q61985 741 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Vps72Q62481 368 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Pcdh19Q80TF3 1145 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Stk16O88697 305 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Epb41P48193 858 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Tmem165P52875 323 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ephb3P54754 993 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Btbd3P58545 530 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Scube3Q66PY1 993 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rad9bQ6WBX7 403 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr412Q7TRW7 312 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Q8BWQ6 963 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Lpcat2Q8BYI6 544 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Far1Q922J9 515 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Orc6Q9WUJ8 262 aa15.95■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 EpoP07321 192 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Anxa4P97429 319 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ptger2Q62053 362 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gpr180Q8BPS4 441 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Slx1bQ8BX32 270 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Cfap61Q8CEL2 1252 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Fndc5Q8K4Z2 209 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Sorcs3Q8VI51 1219 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rhobtb2Q91V93 728 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rin2Q9D684 903 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Hipk3Q9ERH7 1192 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Tsc22d3Q9Z2S7 137 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm5072A2AHM1 344 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm6811E9Q3Y8 510 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Capn6O35646 641 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Etv6P97360 485 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ptcd3Q14C51 685 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 ZufspQ3T9Z9 577 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Pdap1Q3UHX2 181 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Fbxw10Q5SUS0 1030 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Znf473Q8BI67 892 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Colec12Q8K4Q8 742 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 BlmhQ8R016 455 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr1302Q8VGE9 315 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Cby3Q9CVN6 235 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 PaicsQ9DCL9 425 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Crb1Q8VHS2 1405 aa15.94■□□□□ 0.14
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rims2Q9EQZ7 1530 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.5 ms