RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mrps17Q9CQE3 120 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Arl2Q9D0J4 184 aa13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem174Q9DCX7 243 aa13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PolhQ9JJN0 694 aa13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Abhd12bG3UZN6 359 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ring1O35730 406 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pias1O88907 651 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rag1P15919 1040 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gja1P23242 382 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Elk3P41971 409 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sox13Q04891 613 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rgs9bpQ148R9 237 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pdss1Q33DR2 409 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Phactr4Q501J7 694 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Bdkrb1Q61125 334 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Got1l1Q7TSV6 404 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rbm22Q8BHS3 420 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Noc4lQ8BHY2 516 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gbp5Q8CFB4 590 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr847Q8VFF4 312 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gprc5bQ923Z0 410 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CoprsQ9CQ13 173 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Decr1Q9CQ62 335 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q9D1F3 157 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kbtbd12Q9D618 625 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Neu2Q9JMH3 379 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Plod1Q9R0E2 728 aa13.33□□□□□ -0.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 DcxO88809 366 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Opa1P58281 960 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pitx1P70314 315 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Neurog1P70660 244 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 IdsQ08890 552 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Alkbh5Q3TSG4 395 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp217Q3U0X6 1041 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 AcrbpQ3V140 540 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 LpoQ5SW46 710 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 C1qtnf6Q6IR41 264 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Galnt10Q6P9S7 603 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nek5Q7TSC3 627 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 TdrkhQ80VL1 560 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Smoc1Q8BLY1 463 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Znf76Q8BMU0 568 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Znf668Q8K2R5 619 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cplx3Q8R1B5 158 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dact1Q8R4A3 778 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Yaf2Q99LW6 179 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Stau1Q9Z108 487 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm29133A0A1B0GT72 266 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ralgps1A2AR50 585 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nhsl2B1AXH1 854 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 H2-T24F8VQG4 363 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 FaahO08914 579 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Chrna4O70174 629 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 MaptP10637 733 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gdf5P43027 495 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Upp1P52624 311 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 MafkQ61827 156 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cox8aQ64445 69 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Glra2Q7TNC8 452 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp62Q8C827 914 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc36a1Q8K4D3 475 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pcdhb18Q91Y02 792 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cdc26Q99JP4 85 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Abcf2Q99LE6 628 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q9D979 236 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Prmt1Q9JIF0 371 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mpp5Q9JLB2 675 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Grb14Q9JLM9 538 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 XkQ9QXY7 446 aa13.33□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cep290Q6A078 2472 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm8882E9Q7E4 283 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm7073E9QAS1 335 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tnfrsf11bO08712 401 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nt5dc3Q3UHB1 546 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem255bQ5FW56 369 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccnt2Q7TQK0 723 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem120aQ8C1E7 343 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 4931406P16RikQ8C5X1 1059 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zc2hc1cQ8CCG1 527 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ddx18Q8K363 660 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 SardhQ99LB7 919 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr703Q9EPF5 319 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Aff1O88573 1216 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sp1O89090 784 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 BtkP35991 659 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Casp4P70343 373 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q3UTZ3 580 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gngt1Q61012 74 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ankrd6Q69ZU8 712 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ggnbp1Q6K1E7 370 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cand1Q6ZQ38 1230 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rnf187Q8BFX1 236 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ldlrap1Q8C142 308 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Proser2Q8C5R2 471 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Asb14Q8C6Y6 587 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sh2d5Q8JZW5 429 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr784Q8VFZ9 319 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Elmod3Q91YP6 381 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tas1r2Q925I4 843 aa13.32□□□□□ -0.28
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ophn1Q99J31 802 aa13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32 ms