RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616502.4

EPHB4-210, Transcript of EPH receptor B4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene EPHB4, Length 3,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4-210ENST00000616502 TMC7Q7Z402 723 aa14.66□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CXorf38Q8TB03 319 aa14.66□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 USP33Q8TEY7 942 aa14.66□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 PCYT2Q99447 389 aa14.66□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 LGMNQ99538 433 aa14.66□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 NPAS2Q99743 824 aa14.66□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CCDC106Q9BWC9 280 aa14.66□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.66□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.66□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 SDK1Q7Z5N4 2213 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 ASB14A6NK59 587 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 METTL18O95568 372 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 ITGAXP20702 1163 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CCR3P51677 355 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 EFNA5P52803 228 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 STX1BP61266 288 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CCNIQ14094 377 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CCL14Q16627 93 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 DGKDQ16760 1214 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 NIPA1Q7RTP0 329 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 GPR141Q7Z602 305 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 DNERQ8NFT8 737 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.068e-7■■■■□ 21.9
EPHB4-210ENST00000616502 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 PTTG2Q9NZH5 202 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 FETUBQ9UGM5 382 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 NUDT5Q9UKK9 219 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 BIRC5O15392 142 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 TRIM13O60858 407 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 PIK3R1P27986 724 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 TMEM198Q66K66 360 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 PACS1Q6VY07 963 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CDT1Q9H211 546 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 SNX25Q9H3E2 840 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 PLIN3O60664 434 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 MPSTP25325 297 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 NR1H2P55055 460 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CCDC142Q17RM4 750 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 DSELQ8IZU8 1212 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 SNX31Q8N9S9 440 aa14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 SLC25A27O95847 323 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 MAP3K10Q02779 954 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 DLG2Q15700 870 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 MPZL3Q6UWV2 235 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 SIK2Q9H0K1 926 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 CCDC167Q9P0B6 97 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 PLA2G6O60733 806 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 NDST1P52848 882 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 XYLT1Q86Y38 959 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 CIB1Q99828 191 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 MID2Q9UJV3 735 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 AP4E1Q9UPM8 1137 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 M0QZ92 97 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 ADCY6O43306 1168 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 TSHRP16473 764 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 THOP1P52888 689 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 GRIK4Q16099 956 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 LPPQ93052 612 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 CNDP1Q96KN2 507 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 OMDQ99983 421 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 SIRPGQ9P1W8 387 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 DMTF1Q9Y222 760 aa14.64□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.63□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.63□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 AOC1P19801 751 aa14.63□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 GP5P40197 560 aa14.63□□□□□ -0.07
EPHB4-210ENST00000616502 CDH15P55291 814 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms