RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 GIPC1O14908 333 aa19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 ADCY5O95622 1261 aa19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 RDXP35241 583 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 PSMD8P48556 350 aa19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 STK19P49842 368 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 CDH4P55283 916 aa19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 NOMO3P69849 1222 aa19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 CDR2Q01850 454 aa19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 CST6Q15828 149 aa19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 C9orf64Q5T6V5 341 aa19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 USP30Q70CQ3 517 aa19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC20A1Q8WUM9 679 aa19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 MYO19Q96H55 970 aa19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 TBCBQ99426 244 aa19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 LAMA1P25391 3075 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 LRRC72A6NJI9 287 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 MID1O15344 667 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 ADH1BP00325 375 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 IL1BP01584 269 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 RHOCP08134 193 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC8A1P32418 973 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 CXCR3P49682 368 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 KRT83P78385 493 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 GRIK2Q13002 908 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 ARID5BQ14865 1188 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 IL27RAQ6UWB1 636 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 TRIM72Q6ZMU5 477 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 DSG4Q86SJ6 1040 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 C14orf80Q86SX3 495 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 STK40Q8N2I9 435 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 AOPEPQ8N6M6 819 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 OR2I1PQ8NGU4 316 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 A0A1W2PP55 124 aa19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 LGALS16A8MUM7 142 aa19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 BNIP3LO60238 219 aa19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 SRGAP2O75044 1071 aa19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 CER1O95813 267 aa19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 NSFP46459 744 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 PLK1P53350 603 aa19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 ATP11AP98196 1134 aa19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 TYRO3Q06418 890 aa19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 FOXC1Q12948 553 aa19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 ARL13BQ3SXY8 428 aa19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 CFAP57Q96MR6 1250 aa19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 FEM1AQ9BSK4 669 aa19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 ITIH6Q6UXX5 1313 aa19.73■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 CEP192Q8TEP8 1941 aa19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 SMTNL1A8MU46 457 aa19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC172P0C7W6 258 aa19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 SDC4P31431 198 aa19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 FLT3P36888 993 aa19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 SEMA3BQ13214 749 aa19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC14A1Q13336 389 aa19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 CDO1Q16878 200 aa19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC30A5Q8TAD4 765 aa19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 OR8D1Q8WZ84 308 aa19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 SKA1Q96BD8 255 aa19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 C11orf70Q9BRQ4 267 aa19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 NEUROG2Q9H2A3 272 aa19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 GAREM1Q9H706 876 aa19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 SIK3Q9Y2K2 1263 aa19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 NCOR2Q9Y618 2525 aa19.72■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 GON4LQ3T8J9 2241 aa19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 C5AR1P21730 350 aa19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 PMLP29590 882 aa19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 OR1E1P30953 314 aa19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 JAM2P57087 298 aa19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 FMO1Q01740 532 aa19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 FILIP1LQ4L180 1135 aa19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 C6orf118Q5T5N4 469 aa19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM46CQ5VWP2 391 aa19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 KIAA0895LQ68EN5 471 aa19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM131BQ86XD5 332 aa19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 EMC1Q8N766 993 aa19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 ATP11CQ8NB49 1132 aa19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 OR14C36Q8NHC7 312 aa19.71■□□□□ 0.75
ANKRD54-211ENST00000609454 PTPRN2Q92932 1015 aa19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms