RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600026.5

LTBP4-227, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 3

Gene LTBP4, Length 723 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-227	ENST00000600026	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		22.58	■■□□□ 1.21
LTBP4-227	ENST00000600026	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		22.58	■■□□□ 1.21
LTBP4-227	ENST00000600026	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		22.58	■■□□□ 1.21
LTBP4-227	ENST00000600026	FAM72B	Q86X60	149 aa		22.58	■■□□□ 1.21
LTBP4-227	ENST00000600026	MFN1	Q8IWA4	741 aa		22.58	■■□□□ 1.21
LTBP4-227	ENST00000600026	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		22.58	■■□□□ 1.21
LTBP4-227	ENST00000600026	KIF18A	Q8NI77	898 aa		22.58	■■□□□ 1.21
LTBP4-227	ENST00000600026	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	22.58	■■□□□ 1.21
LTBP4-227	ENST00000600026	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		22.58	■■□□□ 1.21
LTBP4-227	ENST00000600026	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		22.58	■■□□□ 1.21
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF670	Q9BS34	389 aa		22.58	■■□□□ 1.21
LTBP4-227	ENST00000600026	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	22.58	■■□□□ 1.21
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		22.58	■■□□□ 1.21
LTBP4-227	ENST00000600026	NEU3	Q9UQ49	428 aa		22.58	■■□□□ 1.21
LTBP4-227	ENST00000600026	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		22.58	■■□□□ 1.21
LTBP4-227	ENST00000600026	FAM170B	A6NMN3	283 aa		22.57	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	DRGX	A6NNA5	263 aa		22.57	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF487	B1APH4	448 aa		22.57	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	CNTN5	O94779	1100 aa		22.57	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	LRIG2	O94898	1065 aa		22.57	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	APOD	P05090	189 aa		22.57	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	PYGM	P11217	842 aa		22.57	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	DRD1	P21728	446 aa		22.57	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	SEMA3B	Q13214	749 aa		22.57	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	22.57	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	CHST9	Q7L1S5	443 aa		22.57	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		22.57	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	TERB1	Q8NA31	727 aa		22.57	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		22.57	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	NELL2	Q99435	816 aa		22.57	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	22.57	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	22.57	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		22.57	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026		H0Y626	953 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	CES2	O00748	559 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	CD48	P09326	243 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	CHRNB1	P11230	501 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	GOT1	P17174	413 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	HLA-F	P30511	346 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	CXCR5	P32302	372 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	GRIA2	P42262	883 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	CDH4	P55283	916 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	CDH18	Q13634	790 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	CCIN	Q13939	588 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	PPP2R5E	Q16537	467 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	TSC1	Q92574	1164 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	MPP6	Q9NZW5	540 aa		22.56	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	FANCG	O15287	622 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	CEP104	O60308	925 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	CLDN11	O75508	207 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	AOC1	P19801	751 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	EPHB2	P29323	1055 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	PTPN7	P35236	360 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	CDKN2B	P42772	138 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	FZD5	Q13467	585 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	LRRC32	Q14392	662 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	GEN1	Q17RS7	908 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	RFX8	Q6ZV50	586 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	RFX6	Q8HWS3	928 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	22.55	■■□□□ 1.2	7e-8	■■■■□ 21.2
LTBP4-227	ENST00000600026	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	RNF157	Q96PX1	679 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		22.55	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		22.54	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	22.54	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	HOXC13	P31276	330 aa		22.54	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	CD70	P32970	193 aa		22.54	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	LMAN2	Q12907	356 aa		22.54	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	MMRN1	Q13201	1228 aa		22.54	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	TFDP2	Q14188	446 aa		22.54	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	TAZ	Q16635	292 aa		22.54	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	FSCB	Q5H9T9	825 aa		22.54	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	FBXL6	Q8N531	539 aa		22.54	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	FAF2	Q96CS3	445 aa		22.54	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	LMLN	Q96KR4	655 aa		22.54	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		22.54	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		22.54	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		22.54	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		22.54	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	DONSON	Q9NYP3	566 aa		22.54	■■□□□ 1.2
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		22.54	■■□□□ 1.2

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