RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCG1P45844 678 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ACADSBP45954 432 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 RXRGP48443 463 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 STK19P49842 368 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CLDN6P56747 220 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 NXPH1P58417 271 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP2CBP62714 309 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP2CAP67775 309 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 GCNT1Q02742 428 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CETN1Q12798 172 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC45A4Q5BKX6 768 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 C6orf118Q5T5N4 469 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SYPL2Q5VXT5 272 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 RAP1GAP2Q684P5 730 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 RRAGAQ7L523 313 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CHSY1Q86X52 802 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ARHGEF19Q8IW93 802 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 EID2Q8N6I1 236 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TSC1Q92574 1164 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SMARCE1Q969G3 411 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM131CQ96AQ9 280 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 BTN2A3PQ96KV6 586 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CEP63Q96MT8 703 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM62Q9BVG3 475 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ST7Q9NRC1 585 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TJP2Q9UDY2 1190 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SHROOM3Q8TF72 1996 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 DOCK9Q9BZ29 2069 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D3EA0A087X179 549 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D3LB9A6J9 549 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CAPN9O14815 690 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PSMA7O14818 248 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D3HP0C7X1 549 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 VAV1P15498 845 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TACR2P21452 398 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 NNMTP40261 264 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 METAP1P53582 386 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 BNIP3Q12983 259 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 STIM1Q13586 685 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC12A1Q13621 1099 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC40Q4G0X9 1142 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 HES3Q5TGS1 186 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SFMBT2Q5VUG0 894 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 FBXL19Q6PCT2 694 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 OXR1Q8N573 874 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 MFSD2AQ8NA29 543 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 STK32AQ8WU08 396 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 FRS2Q8WU20 508 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 KREMEN1Q96MU8 473 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SPAG5Q96R06 1193 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC4A5Q9BY07 1137 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 KDM4CQ9H3R0 1056 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 POPDC2Q9HBU9 364 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CNTN6Q9UQ52 1028 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1B0GVM2 712 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TCAF2A6NFQ2 919 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 E5RJQ4 531 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 F5H5T6 163 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC7A4O43246 635 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CD44P16070 742 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PDGFRAP16234 1089 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ITPKBP27987 946 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 NUDT1P36639 197 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 NUMBP49757 651 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 VASPP50552 380 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PLK1P53350 603 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 NUCB2P80303 420 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SEMG2Q02383 582 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 SULT2A1Q06520 285 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 ILKQ13418 452 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 RTP5Q14D33 572 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 MEA1Q16626 185 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-226ENST00000593200 TTI2Q6NXR4 508 aa10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms