RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593072.5

EFTUD2-225, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 5

Gene EFTUD2, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-225	ENST00000593072	CMA1	P23946	247 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	LSS	P48449	732 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	RGS7	P49802	495 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	RAD23B	P54727	409 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	TBX4	P57082	545 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF445	P59923	1031 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PPP3CA	Q08209	521 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CDH18	Q13634	790 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	ACCSL	Q4AC99	568 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	RAB41	Q5JT25	222 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	COLEC12	Q5KU26	742 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	APCDD1	Q8J025	514 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	LSMEM2	Q8N112	164 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	EXD3	Q8N9H8	876 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	MAPK15	Q8TD08	544 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CALN1	Q9BXU9	219 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	DPH1	Q9BZG8	443 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	FZD3	Q9NPG1	666 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	THSD1	Q9NS62	852 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CISH	Q9NSE2	258 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	EXOC1	Q9NV70	894 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	FZD4	Q9ULV1	537 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	SATB2	Q9UPW6	733 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	HPSE	Q9Y251	543 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	MYH11	P35749	1972 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072		K7ENP7	123 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	AGRP	O00253	132 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PDXK	O00764	312 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	NEBL	O76041	1014 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	LATS1	O95835	1130 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	THEGL	P0DJG4	465 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	C7	P10643	843 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	ALPPL2	P10696	532 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PRLR	P16471	622 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	NNMT	P40261	264 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CSRP3	P50461	194 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	NDUFA8	P51970	172 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CLDN2	P57739	230 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	ECT2L	Q008S8	904 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	KCNMA1	Q12791	1236 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	SGO2	Q562F6	1265 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	DCAF6	Q58WW2	860 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	MPP7	Q5T2T1	576 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	LGI2	Q8N0V4	545 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR4C6	Q8NH72	309 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	IFI44	Q8TCB0	444 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	SEMA4D	Q92854	862 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PTPRN2	Q92932	1015 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	ARRDC3	Q96B67	414 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	LMLN	Q96KR4	655 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	APOLD1	Q96LR9	279 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	MIS12	Q9H081	205 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	HESX1	Q9UBX0	185 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	SARDH	Q9UL12	918 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-225	ENST00000593072	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		6.55	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms