RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 HDHD2Q9H0R4 259 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 TSPAN3O60637 253 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 URODP06132 367 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 XRCC4Q13426 336 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 ACAP1Q15027 740 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 STK32CQ86UX6 486 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 FAM81AQ8TBF8 368 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 OLFM1Q99784 485 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 CCT3P49368 545 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 ITGADQ13349 1161 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 PYDC1Q8WXC3 89 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 APOL4Q9BPW4 351 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 GRIP2Q9C0E4 1043 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 ASB7Q9H672 318 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 KCND1Q9NSA2 647 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 DIP2BQ9P265 1576 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 TSPAN9O75954 239 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 ANKS6Q68DC2 871 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 WDR59Q6PJI9 974 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 C9orf16Q9BUW7 83 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 TISP43B9A030 160 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 E5RJQ4 531 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 ERVK-10P10266 1014 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 DPP10Q8N608 796 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD49Q8WVL7 239 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 CKAP2Q8WWK9 683 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 CENPTQ96BT3 561 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 PIK3C2BO00750 1634 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 PKNOX1P55347 436 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 METTL6Q8TCB7 284 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO44Q9H4M3 255 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 RPL14P50914 215 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 ENKURQ8TC29 256 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 HMG20AQ9NP66 347 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 BTN3A1O00481 513 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.071e-11■□□□□ 9.6
PTPRM-211ENST00000580170 PPP2R1BP30154 601 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 FMO4P31512 558 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 PLK1P53350 603 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 CNGA2Q16280 664 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 CASP12Q6UXS9 341 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 ZPBP2Q6X784 338 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 REPS2Q8NFH8 660 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 ATP13A1Q9HD20 1204 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 TGFB3P10600 412 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 RORBQ92753 470 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 SLC25A23Q9BV35 468 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 SERHL2Q9H4I8 314 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 SERHLQ9NQF3 203 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 MBD2Q9UBB5 411 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 MEGF6O75095 1541 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 LCA5LO95447 670 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 NPNTQ6UXI9 565 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 MTMR9Q96QG7 549 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF446Q9NWS9 450 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF112Q9UJU3 913 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 EPHX4Q8IUS5 362 aa21.7■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 LZTR1Q8N653 840 aa21.7■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 SETD9Q8NE22 299 aa21.7■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 ITFG1Q8TB96 612 aa21.7■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 RNFT2Q96EX2 444 aa21.7■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 CIPCQ9C0C6 399 aa21.7■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 WDR41Q9HAD4 459 aa21.7■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.7■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ACKR2O00590 384 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PIGNO95427 931 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CALCAP01258 141 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 HPGDP15428 266 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINB11Q96P15 392 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 USP12O75317 370 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CKBP12277 381 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 FGFR3P22607 806 aa21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms