RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507965.5

ATXN3-210, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 2

Gene ATXN3, Length 708 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-210ENST00000507965 TERB1Q8NA31 727 aa5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 SCAMP5Q8TAC9 235 aa5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 FBXO32Q969P5 355 aa5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 P2RY11Q96G91 374 aa5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 C8orf48Q96LL4 319 aa5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 KCNK16Q96T55 309 aa5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 ACOX2Q99424 681 aa5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 ELOVL4Q9GZR5 314 aa5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 SDCBP2Q9H190 292 aa5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 XYLT2Q9H1B5 865 aa5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 SNX25Q9H3E2 840 aa5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 GMIPQ9P107 970 aa5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 RAD54BQ9Y620 910 aa5.86□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 CEP295Q9C0D2 2601 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 IGF2RP11717 2491 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 A0A1W2PQF6 199 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 E2F8A0AVK6 867 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 A8MXQ7 604 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 GREM1O60565 184 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 TACC1O75410 805 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 BEST1O76090 585 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 ALDH1A2O94788 518 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 CLSTN1O94985 981 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 CCDC130P13994 396 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 HOXB2P14652 356 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 PFKLP17858 780 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 TNNI1P19237 187 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 YWHAQP27348 245 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 GSTT1P30711 240 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 ASIC1P78348 528 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 SEMA3BQ13214 749 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 PSMD6Q15008 389 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 SLC39A14Q15043 492 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 NKG7Q16617 165 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 ANO4Q32M45 955 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 EOGTQ5NDL2 527 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 FAM26FQ5R3K3 315 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 HDXQ7Z353 690 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 ZNF605Q86T29 641 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 TMEM25Q86YD3 366 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 IRF2BP1Q8IU81 584 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 SYT12Q8IV01 421 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 NUP93Q8N1F7 819 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 ZMIZ2Q8NF64 920 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 SCFD1Q8WVM8 642 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 JAKMIP2Q96AA8 810 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 DHX58Q96C10 678 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 CEP295NLQ96MC4 621 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 CAMK1GQ96NX5 476 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 SLITRK1Q96PX8 696 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 BLZF1Q9H2G9 400 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 TNMDQ9H2S6 317 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 ACBD3Q9H3P7 528 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 CD248Q9HCU0 757 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 FAM49BQ9NUQ9 324 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 KBTBD4Q9NVX7 518 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 OSER1Q9NX31 292 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 PILRBQ9UKJ0 227 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 CYP8B1Q9UNU6 501 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 MTMR6Q9Y217 621 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 UBE4BO95155 1302 aa5.84□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 TBC1D3BA6NDS4 549 aa5.84□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 PRRT4C9JH25 899 aa5.84□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa5.84□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 MDM4O15151 490 aa5.84□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 SEMA7AO75326 666 aa5.84□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 VNN1O95497 513 aa5.84□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 TBX18O95935 607 aa5.84□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 GRIA2P42262 883 aa5.84□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 TNFRSF4P43489 277 aa5.84□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 PPP3CCP48454 512 aa5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms