RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 MFSD4BQ5TF39 518 aa13.61□□□□□ -0.23
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HDLBP-241ENST00000487169 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa13.61□□□□□ -0.23
HDLBP-241ENST00000487169 DSG4Q86SJ6 1040 aa13.61□□□□□ -0.23
HDLBP-241ENST00000487169 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
HDLBP-241ENST00000487169 SEMA4DQ92854 862 aa13.61□□□□□ -0.23
HDLBP-241ENST00000487169 UROC1Q96N76 676 aa13.61□□□□□ -0.23
HDLBP-241ENST00000487169 COL20A1Q9P218 1284 aa13.61□□□□□ -0.23
HDLBP-241ENST00000487169 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
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HDLBP-241ENST00000487169 B4GALT4O60513 344 aa13.6□□□□□ -0.23
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HDLBP-241ENST00000487169 CCDC153Q494R4 210 aa13.6□□□□□ -0.23
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HDLBP-241ENST00000487169 SEMA3CQ99985 751 aa13.59□□□□□ -0.23
HDLBP-241ENST00000487169 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
HDLBP-241ENST00000487169 MIEF1Q9NQG6 463 aa13.59□□□□□ -0.23
HDLBP-241ENST00000487169 ASAH2Q9NR71 780 aa13.59□□□□□ -0.23
HDLBP-241ENST00000487169 SPG21Q9NZD8 308 aa13.59□□□□□ -0.23
HDLBP-241ENST00000487169 LIASO43766 372 aa13.59□□□□□ -0.23
HDLBP-241ENST00000487169 STAU1O95793 577 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
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