RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	C2CD2L	O14523	706 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	GPR171	O14626	319 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	PSMA7	O14818	248 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	PCDH17	O14917	1159 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ASNA1	O43681	348 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	MMP20	O60882	483 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	TSPAN9	O75954	239 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	TMCC1	O94876	653 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	MFN2	O95140	757 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	NDST3	O95803	873 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CLEC3B	P05452	202 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	UMPS	P11172	480 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CD33	P20138	364 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ADRA1D	P25100	572 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	PTPN3	P26045	913 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	3.33	□□□□□ -1.88	1e-7	■■□□□ 14.1
TTC3-214	ENST00000472398	PTPN6	P29350	595 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	AVPR2	P30518	371 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ALDH3A1	P30838	453 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CHRNA3	P32297	505 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ETV5	P41161	510 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ALDH1A3	P47895	512 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ARSE	P51690	589 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ADCY7	P51828	1080 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	TAS2R40	P59535	323 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	RAB1A	P62820	205 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CTBS	Q01459	385 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ZP2	Q05996	745 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SMARCB1	Q12824	385 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	MAMLD1	Q13495	774 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	TDG	Q13569	410 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	3.33	□□□□□ -1.88	4e-10	■■□□□ 13.1
TTC3-214	ENST00000472398	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	MYLK3	Q32MK0	819 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	KCTD11	Q693B1	232 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	UNC13D	Q70J99	1090 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ASPG	Q86U10	573 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SAAL1	Q96ER3	474 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	TM9SF2	Q99805	663 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	NOD2	Q9HC29	1040 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM140	Q9NV12	185 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SPAST	Q9UBP0	616 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CD300A	Q9UGN4	299 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	KCND3	Q9UK17	655 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SATB2	Q9UPW6	733 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	LRRC42	Q9Y546	428 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	PRDM2	Q13029	1718 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	LRRD1	A4D1F6	860 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398		E9PMD0	336 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398		H3BQV1	296 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	PPP6R2	O75170	966 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	NDUFS2	O75306	463 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SASH3	O75995	380 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	RNF8	O76064	485 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	IL18RAP	O95256	599 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	PDE8B	O95263	885 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	AK1	P00568	194 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CLU	P10909	449 aa		3.32	□□□□□ -1.88

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