RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 SENP8Q96LD8 212 aa20.94■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 PANX3Q96QZ0 392 aa20.94■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 RBBP8Q99708 897 aa20.94■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 APOL2Q9BQE5 337 aa20.94■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.94■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 F8W8V4 182 aa20.94■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 FBXO21O94952 628 aa20.94■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.94■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 POU5F2Q8N7G0 328 aa20.94■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.94■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 SOX13Q9UN79 622 aa20.94■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.93■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 FAM35AQ86V20 835 aa20.93■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 EDEM1Q92611 657 aa20.93■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 PCED1BQ96HM7 432 aa20.93■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 SYT15Q9BQS2 421 aa20.93■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 C1orf21Q9H246 121 aa20.93■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.93■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.93■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.93■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.947e-7■■□□□ 12
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IMP4-208ENST00000460766 CACNA2D1P54289 1103 aa20.93■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 SLC25A3Q00325 362 aa20.93■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 SEMA3BQ13214 749 aa20.93■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.93■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.93■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.93■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.92■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 SCAPQ12770 1279 aa20.92■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB17Q13105 803 aa20.92■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 UBP1Q9NZI7 540 aa20.92■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 USP1O94782 785 aa20.92■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 SKIP12755 728 aa20.92■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 ACTR3P61158 418 aa20.92■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 A0A096LPK6 155 aa20.91■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.91■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 PTPN18Q99952 460 aa20.91■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.91■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 WDCPQ9H6R7 721 aa20.91■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.91■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.91■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 HAS3O00219 553 aa20.9■□□□□ 0.94
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