RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TJP2Q9UDY2 1190 aa13.61□□□□□ -0.23
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STK19P49842 368 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGEF19Q8IW93 802 aa13.6□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F5H5T6 163 aa13.59□□□□□ -0.23
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D3EA0A087X179 549 aa13.58□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa13.58□□□□□ -0.24
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METAP1P53582 386 aa13.58□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUCB2P80303 420 aa13.58□□□□□ -0.24
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ILKQ13418 452 aa13.58□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STIM1Q13586 685 aa13.58□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa13.58□□□□□ -0.24
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa13.58□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa13.58□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRSN2Q9GZP1 204 aa13.58□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KDM4CQ9H3R0 1056 aa13.58□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POPDC2Q9HBU9 364 aa13.58□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa13.58□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYTH4Q9UIA0 394 aa13.58□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AK5Q9Y6K8 562 aa13.58□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHROOM3Q8TF72 1996 aa13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GVM2 712 aa13.57□□□□□ -0.24
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