RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364005.1

RNU6-340P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 340, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-340P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-340P-201ENST00000364005 DOK6Q6PKX4 331 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 CYB5R4Q7L1T6 521 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 DSG4Q86SJ6 1040 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 SPARTQ8N0X7 666 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 METTL25Q8N6Q8 603 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 KDM1BQ8NB78 822 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP0.06□□□□□ -2.4
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RNU6-340P-201ENST00000364005 KAT5Q92993 513 aa0.06□□□□□ -2.4
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RNU6-340P-201ENST00000364005 BARHL2Q9NY43 387 aa0.06□□□□□ -2.4
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RNU6-340P-201ENST00000364005 VPS4AQ9UN37 437 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 CDC14AQ9UNH5 594 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 ARID1AO14497 2285 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 A0A087WWL8 130 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 TTC34A8MYJ7 566 aa0.05□□□□□ -2.4
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RNU6-340P-201ENST00000364005 SGPL1O95470 568 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 INHBAP08476 426 aa0.05□□□□□ -2.4
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RNU6-340P-201ENST00000364005 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP0.05□□□□□ -2.4
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RNU6-340P-201ENST00000364005 ITGA9Q13797 1035 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 CACHD1Q5VU97 1274 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 PPP4R3AQ6IN85 833 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 ZNF547Q8IVP9 402 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 DSELQ8IZU8 1212 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 Q8N377 158 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 SLC25A41Q8N5S1 370 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
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RNU6-340P-201ENST00000364005 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 GRHL3Q8TE85 626 aa0.05□□□□□ -2.4
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RNU6-340P-201ENST00000364005 ZNRF4Q8WWF5 429 aa0.05□□□□□ -2.4
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RNU6-340P-201ENST00000364005 SAP30LQ9HAJ7 183 aa0.05□□□□□ -2.4
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RNU6-340P-201ENST00000364005 LRFN1Q9P244 771 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 DKK4Q9UBT3 224 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 ASIC3Q9UHC3 531 aa0.05□□□□□ -2.4
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RNU6-340P-201ENST00000364005 RAI2Q9Y5P3 530 aa0.05□□□□□ -2.4
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RNU6-340P-201ENST00000364005 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 P0C879 139 aa0.04□□□□□ -2.4
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RNU6-340P-201ENST00000364005 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP0.04□□□□□ -2.4
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RNU6-340P-201ENST00000364005 CEBPBP17676 345 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 MCM3P25205 808 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 NDUFS1P28331 727 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 GPR3P46089 330 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 FMO5P49326 533 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 PGFP49763 221 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 GATMP50440 423 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 UCP3P55916 312 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 NDPQ00604 133 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 DMWDQ09019 674 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 DNASE1L3Q13609 305 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-340P-201ENST00000364005 CALCRLQ16602 461 aa0.04□□□□□ -2.4
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