RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 EPGNQ6UW88 154 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 DEFB107AQ8IZN7 70 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 GBP5Q96PP8 586 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM192AQ9GZU8 254 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 CITO14578 2027 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 MAGEB16A2A368 324 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 DCXO43602 365 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 PDE5AO76074 875 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 GMPRP36959 345 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 AIF1P55008 147 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 USP4Q13107 963 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 RAPH1Q70E73 1250 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 TP53INP2Q8IXH6 220 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF781Q8N8C0 355 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 SHKBP1Q8TBC3 707 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 TSPAN18Q96SJ8 248 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC9A7Q96T83 725 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 KATNBL1Q9H079 304 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 PIGVQ9NUD9 493 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 USP12O75317 370 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 ERCC2P18074 760 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 ITGAXP20702 1163 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 AXLP30530 894 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 ADRA1BP35368 520 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 OLIG2Q13516 323 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 CUL3Q13618 768 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 CCNIQ14094 377 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 PHTF2Q8N3S3 785 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 FBXW8Q8N3Y1 598 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC2A13Q96QE2 648 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 AGAP2Q99490 1192 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 CASS4Q9NQ75 786 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 OTOFQ9HC10 1997 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 G3V2L1 256 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 MAP3K13O43283 966 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 TIMM44O43615 452 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIM13O60858 407 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 GNAT1P11488 350 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 COX4I1P13073 169 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 KCNE1P15382 129 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 SMPD1P17405 629 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 WARSP23381 471 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 NDUFV1P49821 464 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 FRMD7Q6ZUT3 714 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 URGCPQ8TCY9 931 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC28BQ9BUN5 200 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 POMPQ9Y244 141 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 GTF2A2P52657 109 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 PDSS2Q86YH6 399 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 TOP6BLQ8N6T0 577 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 PHC3Q8NDX5 983 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 BRD8Q9H0E9 1235 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 NMRAL1Q9HBL8 299 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 MID2Q9UJV3 735 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 CLDN5O00501 218 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 MTSS1O43312 755 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 BEST1O76090 585 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 ZCCHC18P0CG32 403 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 LILRA4P59901 499 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 XIAPP98170 497 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 CLEC14AQ86T13 490 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 AZIN2Q96A70 460 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 CDCA5Q96FF9 252 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 KCNK16Q96T55 309 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 RTKNQ9BST9 563 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 KLHL4Q9C0H6 718 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 E9PBE3 544 aa21.94■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 KLHL41O60662 606 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms