RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298316.6

ARF6-201, Transcript of ADP ribosylation factor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARF6, Length 3,865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6-201ENST00000298316 CDY1Q9Y6F8 540 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 RAMP2O60895 175 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 CCND1P24385 295 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 GPR15P49685 360 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 CSHL1Q14406 222 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 CKAP2Q8WWK9 683 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 SNX3O60493 162 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 ANXA9O76027 345 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 PROZP22891 400 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 DAOAP59103 153 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 GRIK3Q13003 919 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 ART3Q13508 389 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 KIF19Q2TAC6 998 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 ZNF470Q6ECI4 717 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 POU5F2Q8N7G0 328 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 CRTAC1Q9NQ79 661 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 RHBDL2Q9NX52 303 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 GMIPQ9P107 970 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 CRYL1Q9Y2S2 319 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 MCM3APO60318 1980 aa16.01■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 MTSS1O43312 755 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 L1CAMP32004 1257 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 CLDN10P78369 228 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 CUL3Q13618 768 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 SLC24A5Q71RS6 500 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 KCNMB4Q86W47 210 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 PHF21BQ96EK2 531 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 PIDD1Q9HB75 910 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 CHADO15335 359 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 DNAJC6O75061 913 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 RAG1P15918 1043 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 C1orf146Q5VVC0 180 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 TMEM110Q86TL2 294 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 ZNF280BQ86YH2 543 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 MFSD3Q96ES6 412 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 SLC4A5Q9BY07 1137 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 WWP1Q9H0M0 922 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 ABCC13Q9NSE7 274 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 TPP1O14773 563 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 MAP3K7O43318 606 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 DAB1O75553 588 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 CCNB1P14635 433 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 SERPINB3P29508 390 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 RPL9P32969 192 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 PSEN1P49768 467 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 CDH18Q13634 790 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 MAP7Q14244 749 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 RFWD3Q6PCD5 774 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 STRADAQ7RTN6 431 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 MAF1Q9H063 256 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa16■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 A0A096LPK6 155 aa15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 H0YGN5 161 aa15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 AIM2O14862 343 aa15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 PGM1P36871 562 aa15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 PPM1JQ5JR12 505 aa15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 LAYNQ6UX15 382 aa15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 AGMOQ6ZNB7 445 aa15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 DDIASQ8IXT1 998 aa15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 DDI1Q8WTU0 396 aa15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 HACD3Q9P035 362 aa15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 KANSL3Q9P2N6 904 aa15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 NFS1Q9Y697 457 aa15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 E9PBE3 544 aa15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 KLHL41O60662 606 aa15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 OASLQ15646 514 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 DNAJC9Q8WXX5 260 aa15.99■□□□□ 0.15
ARF6-201ENST00000298316 NFKBIZQ9BYH8 718 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms