RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 SNPHO15079 494 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 PRKAA2P54646 552 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 TMC7Q7Z402 723 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 FAM228AQ86W67 206 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 TBCDQ9BTW9 1192 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 FICDQ9BVA6 458 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 DMTF1Q9Y222 760 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 SHPRHQ149N8 1683 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 CD163L1Q9NR16 1453 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 GSC2O15499 205 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 PDE9AO76083 593 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 NPY2RP49146 381 aa6.45□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 TKTL1P51854 596 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 EML3Q32P44 896 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 KLHL12Q53G59 568 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 MARC1Q5VT66 337 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 SETD9Q8NE22 299 aa6.45□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.45□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.45□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 PRRG1O14668 218 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 AVILO75366 819 aa6.45□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 ADGRE3Q9BY15 652 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.45□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 ADIGQ0VDE8 80 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-201ENST00000267176 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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SBNO1-201ENST00000267176 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.45□□□□□ -1.38
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