RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adamts6D3Z1A5 1117 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ces1bD3Z5G7 567 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp2b23E9Q593 491 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pdzd7E9Q9W7 1021 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atf6F6VAN0 656 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp4f40G3UW81 524 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r39G3UWE6 305 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r88L7N1W8 857 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rgs2O08849 211 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dusp8O09112 663 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tnfaip1O70479 316 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Diaph2O70566 1098 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hsd17b7O88736 334 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P01648 108 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pgk1P09411 417 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atxn1lP0C7T6 687 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fcer2P20693 331 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Crabp2P22935 138 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 BtkP35991 659 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sar1aP36536 198 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 St3gal1P54751 337 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acot8P58137 320 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wdr5P61965 334 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 YwhaqP68254 245 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ptprn2P80560 1001 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trim43bP86448 445 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Bmp1P98063 991 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AxlQ00993 888 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fut7Q11131 389 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tex35Q14BK3 207 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Alkbh5Q3TSG4 395 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znf746Q3U133 652 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Upf3aQ3ULJ3 422 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 FaxcQ3UMF9 409 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lsmem1Q3UQS2 128 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nfe2l2Q60795 597 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gpr65Q61038 337 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krt77Q6IFZ6 572 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm5414Q6IFZ8 552 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MregQ6NVG5 214 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cand1Q6ZQ38 1230 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sytl5Q80T23 753 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ToporsQ80Z37 1033 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znf365Q8BG89 408 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 4933402J07RikQ8BHX0 270 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ano4Q8C5H1 955 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam204aQ8C6C7 236 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc63Q8CDV6 558 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pnpla8Q8K1N1 776 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc36a1Q8K4D3 475 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Asz1Q8VD46 475 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ttc39cQ8VE09 580 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr348Q8VGK3 313 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Setd7Q8VHL1 366 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp4a12aQ91WL5 508 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gemin2Q9CQQ4 269 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Chordc1Q9D1P4 331 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klhdc8bQ9D2D9 354 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q9D9D9 101 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Spatc1lQ9D9W0 342 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dpysl5Q9EQF6 564 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Actn2Q9JI91 894 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tspan3Q9QY33 253 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 M1apQ9Z0E1 529 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wdr46Q9Z0H1 622 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Padi3Q9Z184 664 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cacna2d3Q9Z1L5 1091 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pex11bQ9Z210 259 aa9.48□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cep85lA0A1W2P884 806 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ttc30a2A2AKQ8 664 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1023A2ASU6 311 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pex10B1AUE5 324 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Apba1B2RUJ5 842 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm6588E9Q3K0 461 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Capn2O08529 700 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cacna2d1O08532 1103 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ca3P16015 260 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ap2a1P17426 977 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SagP20443 403 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mmp13P33435 472 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Flt3lgP49772 232 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ndst2P52850 883 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam207aP58468 219 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abi2P62484 446 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pkn1P70268 946 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 StacP97306 403 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sox9Q04887 507 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SnrpaQ62189 287 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr538Q7TRT5 310 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cplx4Q80WM3 160 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NfascQ810U3 1240 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pan2Q8BGF7 1200 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Neto2Q8BNJ6 525 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dcun1d2Q8BZJ7 259 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nlrp4bQ8C6J9 863 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CgasQ8C6L5 507 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rfx6Q8C7R7 927 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Agbl3Q8CDP0 1006 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbxl13Q8CDU4 790 aa9.47□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PvrQ8K094 408 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.4 ms