RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055758.15

Ubr3-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubr3, Length 8,072 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr3-201ENSMUST00000055758 2010005H15RikQ9D8D6 97 aa15.95■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Hbb-bh2B2RVB7 147 aa15.95■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Vmn2r74E9PW21 853 aa15.95■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Tp53P02340 387 aa15.95■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Rnf44Q3UHJ8 407 aa15.95■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Cyp4b1Q64462 511 aa15.95■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 UnkQ8BL48 810 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Ddi1Q9DAF3 408 aa15.95■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Ern1Q9EQY0 977 aa15.95■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Ehd1Q9WVK4 534 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Bpifb9bA2AJD1 591 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 FancfE9Q5Z5 343 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Gm5134E9QAB5 671 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 2610008E11RikG3X964 669 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Tbc1d10aP58802 500 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 RalgdsQ03385 852 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Nlrc4Q3UP24 1024 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Fam198aQ3UY90 562 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Bpifb9aQ80XI7 591 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Reep1Q8BGH4 201 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Scfd2Q8BTY8 684 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Nat14Q8BVG8 206 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Hipk3Q9ERH7 1192 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Gpc6Q9R087 555 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Htra1Q9R118 480 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 XntrpcF8VQM8 1264 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Hk1P17710 974 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Ndufs6P52503 116 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Gnb5P62881 395 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Alkbh5Q3TSG4 395 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Ptpn7Q8BUM3 359 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Mark1Q8VHJ5 795 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Use1Q9CQ56 270 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Acot13Q9CQR4 140 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Trpc2Q9R244 1172 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Larp7Q05CL8 570 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Cand2Q6ZQ73 1235 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Olfr813Q7TRH5 310 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Pcyox1lQ8C7K6 495 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Snx7Q9CY18 387 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Ntrk1Q3UFB7 799 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 N6amt1Q6SKR2 214 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Olfr792Q7TRH9 311 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Slitrk1Q810C1 696 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Nim1kQ8BHI9 436 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Neto2Q8BNJ6 525 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Slc5a4aQ9ET37 656 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Ulk2Q9QY01 1037 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Flt1P35969 1333 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Cyp2c69E9PXC3 491 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Nfatc2ipO09130 412 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Glud1P26443 558 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 DbiP31786 87 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Epha2Q03145 977 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Srbd1Q497V5 1015 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Klhl4B1AZR0 717 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 S100zB9EJL3 99 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Pgam2O70250 253 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 PrkcqQ02111 707 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Mrm3Q5ND52 418 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Tcf4Q60722 670 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Cyp3a11Q64459 504 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Mib1Q80SY4 1006 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Pacs1Q8K212 961 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Rnf135Q9CWS1 417 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Slc34a2Q9DBP0 697 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Flt4P35917 1363 aa15.94■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Spin2-ps6A0A140T8V2 174 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Xlr5bA2BI50 236 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 4931406B18RikA2RSL7 367 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Smim22J3QP37 91 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Ifi203O35368 408 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Hmx1O70218 332 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Drg1P32233 367 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Cyp2j13Q3UNV4 503 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Trim69Q80X56 500 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Adam32Q8K410 754 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Tmco1Q921L3 188 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Trim2Q9ESN6 744 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Vnn1Q9Z0K8 512 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Sult2a7A0A1B0GRF0 313 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Kctd17E0CYQ0 296 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Il1aP01582 270 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 RogdiQ3TDK6 287 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Thoc7Q7TMY4 204 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Pcdh20Q8BIZ0 952 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 SowahdQ8BY98 327 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Itfg1Q99KW9 610 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Tmem68Q9D850 329 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 4930579F01RikE9Q3L6 325 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Eno2P17183 434 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Usp46P62069 366 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Rpl19P84099 196 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 F8a1Q00558 380 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 MelkQ61846 643 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Sat2Q6P8J2 170 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Mapre3Q6PER3 281 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 Calm5Q6W3E0 140 aa15.93■□□□□ 0.14
Ubr3-201ENSMUST00000055758 C2cd2lQ80X80 706 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28 ms