RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pcdha11Q91Y19 950 aa26.8■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sntg2Q925E0 539 aa26.8■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa26.8■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Klc2O88448 599 aa26.8■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tsta3P23591 321 aa26.8■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Klrb1bP27812 223 aa26.8■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abce1P61222 599 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gstt1Q64471 240 aa26.8■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp6nlQ80XC3 819 aa26.8■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Akr1c12Q9JLI0 323 aa26.8■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kcnq2Q9Z351 759 aa26.8■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr1160A2AVT0 319 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm20509G3UZF1 325 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PdgfaP20033 211 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 LdlrP35951 862 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fbxw11Q5SRY7 542 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Psd2Q6P1I6 770 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q80Y73 168 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zbtb41Q811F1 908 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgap18Q8K0Q5 663 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Timp4Q9JHB3 224 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc144bE9PVZ3 520 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vmn2r11E9Q4X4 861 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vps4bP46467 444 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PolgP54099 1218 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Grid2ipQ0QWG9 1203 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Grm5Q3UVX5 1203 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc45a1Q8BIV7 751 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc7a4Q8BLQ7 635 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lin7aQ8JZS0 233 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nup85Q8R480 656 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pcdha6Q91Y14 946 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kdm8Q9CXT6 414 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttll11A4Q9F4 727 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fbxl18E9PYR1 771 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc2a7P0C6A1 513 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pfkfb2P70265 519 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fbp2P70695 339 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gabpb1Q00420 383 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrrc27Q80YS5 523 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CherpQ8CGZ0 936 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Snx9Q91VH2 595 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sike1Q9CPR7 207 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tdp2Q9JJX7 370 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PignQ9R1S3 931 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pappa2E9PZ87 1789 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mettl17Q3U2U7 461 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sema3cQ62181 751 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dach1Q9QYB2 751 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arih2Q9Z1K6 492 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 EsrraO08580 422 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 M6prP24668 278 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc22a16Q497L8 649 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tshz2Q68FE9 1030 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kctd12Q6WVG3 327 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp1Q8BJQ2 784 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nipal1Q8BMW7 416 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 FtcdQ91XD4 541 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Actr3Q99JY9 418 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Serpinb9bQ9DAV6 377 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ern2Q9Z2E3 911 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plxna1P70206 1894 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smok3cA0A087WSF2 504 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dhx35A2ACQ1 703 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 4930426L09RikE9Q0N7 123 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Alas2P08680 587 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atxn10P28658 475 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyth2P63034 400 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 UtyP79457 1212 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slco6c1Q8C0X7 706 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PigxQ99LV7 254 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dlc1Q9R0Z9 1092 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 BC024978J3QPC3 361 aa26.76■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mea1Q64327 174 aa26.76■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 4933402J07RikQ8BHX0 270 aa26.76■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp398Q8BV16 643 aa26.76■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pcdhb13Q91Y06 796 aa26.76■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Wbp11Q923D5 641 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Reep3Q99KK1 254 aa26.76■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim42Q9D2H5 723 aa26.76■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cldn22Q9D7U6 220 aa26.76■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tbc1d20Q9D9I4 402 aa26.76■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp5bP56480 529 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cage1Q5IR70 849 aa26.76■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Clec2eQ80XD9 204 aa26.76■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adgrg3Q8R0T6 542 aa26.76■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tbc1d19Q8VDV7 526 aa26.76■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tspan3Q9QY33 253 aa26.76■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm13276A0A087WR18 182 aa26.75■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 UprtB1AVZ0 310 aa26.75■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm15155B1B034 138 aa26.75■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyp27b1O35084 507 aa26.75■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rps6kl1Q8R2S1 544 aa26.75■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pcdhgb1Q91XX8 918 aa26.75■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Them5Q9CQJ0 248 aa26.75■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Il17rbQ9JIP3 499 aa26.75■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znhit2Q9QY66 399 aa26.75■■□□□ 1.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm36028A0A0U1RPM1 299 aa26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.9 ms