RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	APN1	P22936	367 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	PGS1	P25578	521 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	SAS4	Q04003	481 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	MPD2	Q99316	277 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	STF1	P01098	86 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	NPL4	P33755	580 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	NUP120	P35729	1037 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	EXO84	P38261	753 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	QDR1	P40475	563 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	BNI4	P53858	892 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	PNP1	Q05788	311 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	LAP2	Q10740	671 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	CYT1	P07143	309 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	SRS2	P12954	1174 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	ARG8	P18544	423 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	TMA108	P40462	946 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	TAP42	Q04372	366 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	YDR286C	Q05530	114 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	YOL087C	Q99247	1116 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	CHS3	P29465	1165 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	PEP12	P32854	288 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	NIP100	P33420	868 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	ESL2	P36168	1195 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	BOL3	P39724	118 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	PEX21	P50091	288 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	SWA2	Q06677	668 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	UBP1	P25037	809 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	MNR2	P35724	969 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	ESL1	P40456	1118 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	LEM3	P42838	414 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	YPP1	P46951	817 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	VPS4	P52917	437 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	YNR063W	P53749	607 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	PSR2	Q07949	397 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	ALR1	Q08269	859 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	YPL191C	Q08930	360 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	SRF1	Q12516	437 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	MER1	P16523	270 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	REH1	Q06709	432 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	ESS1	P22696	170 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	KXD1	P53158	218 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	YGR130C	P53278	816 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	MED1	Q12321	566 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	MMP1	Q12372	583 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	PRI2	P20457	528 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	RPC37	P36121	282 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	RKM3	P38222	552 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	RIM4	P38741	713 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	PMT3	P47190	753 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	SAM37	P50110	327 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	PIP2	P52960	996 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	PEX14	P53112	341 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	YML131W	Q03102	365 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.74	□□□□□ -1.81	not detected
SET1	YHR119W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	HO	P09932	586 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	ERR1	P0CX10	437 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	ERR2	P0CX11	437 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	IDI1	P15496	288 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	MEF2	P39677	819 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.74	□□□□□ -1.81	not detected
SET1	YHR119W	RAD33	Q04231	177 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	RNH1	Q04740	348 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	ATG13	Q06628	738 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	NTG2	Q08214	380 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	HNM1	P19807	563 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	GTT3	P39996	337 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	AIM20	P40451	204 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	SUM1	P46676	1062 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	YDR090C	Q03193	310 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	PUN1	Q06991	263 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	FLC1	Q08967	793 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	APC11	Q12157	165 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81

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