RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637699.1

CLN3-262, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 2

Gene CLN3, Length 1,228 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-262ENST00000637699 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.5■■■□□ 2.15
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CLN3-262ENST00000637699 ALS2Q96Q42 1657 aa28.5■■■□□ 2.15
CLN3-262ENST00000637699 BAG6P46379 1132 aa28.48■■■□□ 2.15
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CLN3-262ENST00000637699 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.44■■■□□ 2.14
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CLN3-262ENST00000637699 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.44■■■□□ 2.14
CLN3-262ENST00000637699 STAC3Q96MF2 364 aa28.42■■■□□ 2.14
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CLN3-262ENST00000637699 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.27■■■□□ 2.12
CLN3-262ENST00000637699 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
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CLN3-262ENST00000637699 USP6P35125 1406 aa28■■■□□ 2.07
CLN3-262ENST00000637699 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.99■■■□□ 2.07
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CLN3-262ENST00000637699 PTF1AQ7RTS3 328 aa27.88■■■□□ 2.05
CLN3-262ENST00000637699 LRRC37A3O60309 1634 aa27.88■■■□□ 2.05
CLN3-262ENST00000637699 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.88■■■□□ 2.05
CLN3-262ENST00000637699 COL18A1P39060 1754 aa27.87■■■□□ 2.05
CLN3-262ENST00000637699 PLSCR1O15162 318 aa27.87■■■□□ 2.05
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