RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 ADGRL2O95490 1459 aa11.93□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 ARHGEF5Q12774 1597 aa11.92□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa11.92□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa11.92□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 ST8SIA5O15466 376 aa11.91□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 DAPK1P53355 1430 aa11.91□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.9□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 PTPRGP23470 1445 aa11.9□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 MYO5CQ9NQX4 1742 aa11.9□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 DNAJB2P25686 324 aa11.89□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.89□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 TREML4Q6UXN2 200 aa11.88□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.88□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 AAASQ9NRG9 546 aa11.88□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 ATP10BO94823 1461 aa11.88□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 ARAP3Q8WWN8 1544 aa11.87□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.87□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 PTPRKQ15262 1439 aa11.86□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 ADH1BP00325 375 aa11.86□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 CFHP08603 1231 aa11.86□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 MAST1Q9Y2H9 1570 aa11.86□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.85□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 ITGAEP38570 1179 aa11.84□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.84□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 PLXNC1O60486 1568 aa11.84□□□□□ -0.51
CTXN3-204ENST00000620385 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa11.83□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 KDM5DQ9BY66 1539 aa11.83□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.83□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 PTGDRQ13258 359 aa11.83□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 ABCC5O15440 1437 aa11.83□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.82□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 RCCD1A6NED2 376 aa11.81□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 PLEKHD1A6NEE1 506 aa11.81□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 SLC10A3P09131 477 aa11.81□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 FAM161AQ3B820 660 aa11.81□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 SLC6A16Q9GZN6 736 aa11.81□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC141Q6ZP82 1450 aa11.81□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 TTC37Q6PGP7 1564 aa11.8□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa11.79□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 NR1I2O75469 434 aa11.79□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 FOXC1Q12948 553 aa11.79□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 DACH1Q9UI36 760 aa11.79□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.79□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.78□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CTXN3-204ENST00000620385 ERCC6L2Q5T890 1561 aa11.77□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.77□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa11.77□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 CFAP74Q9C0B2 1584 aa11.76□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 KDM6BO15054 1643 aa11.76□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.76□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 NCOA1Q15788 1441 aa11.76□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 ARHGAP5Q13017 1502 aa11.76□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 SCUBE3Q8IX30 993 aa11.75□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 CRIPAKQ8N1N5 446 aa11.75□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 TONSLQ96HA7 1378 aa11.75□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 UNC13BO14795 1591 aa11.75□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 CFAP44Q96MT7 982 aa11.74□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 ABCC1P33527 1531 aa11.74□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 ABCA9Q8IUA7 1624 aa11.74□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.73□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.72□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 MBD5Q9P267 1494 aa11.72□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.71□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 WFS1O76024 890 aa11.71□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 AVPP01185 164 aa11.71□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 SPSB2Q99619 263 aa11.71□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 TOR4AQ9NXH8 423 aa11.71□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CTXN3-204ENST00000620385 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa11.7□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 DUOX2Q9NRD8 1548 aa11.69□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa11.69□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 PZPP20742 1482 aa11.69□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.69□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 PLCH2O75038 1416 aa11.69□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 ERBINQ96RT1 1412 aa11.69□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 IQGAP3Q86VI3 1631 aa11.68□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 NUTM2FA1L443 756 aa11.67□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 ARID3CA6NKF2 412 aa11.67□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 RPIAP49247 311 aa11.67□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 TEX14Q8IWB6 1497 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 AXIN1O15169 862 aa11.66□□□□□ -0.54
CTXN3-204ENST00000620385 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.9 ms