RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617806.4

BECN1-222, Transcript of beclin 1, human

TSL 5

Gene BECN1, Length 4,865 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BECN1-222	ENST00000617806	SSFA2	P28290	1259 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	SLC4A2	P04920	1241 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	EID1	Q9Y6B2	187 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	GNAI2	P04899	355 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	TRIM29	Q14134	588 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	C8orf34	Q49A92	452 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	CLSTN1	O94985	981 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	PSMA5	P28066	241 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	PDC	P20941	246 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC66	A2RUB6	948 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	HECW1	Q76N89	1606 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	ABCC5	O15440	1437 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	APP	P05067	770 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	SMC2	O95347	1197 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	CLCN1	P35523	988 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	PDILT	Q8N807	584 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	PRAM1	Q96QH2	718 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	TRDN	Q13061	729 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	TRIM27	P14373	513 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	KRT85	P78386	507 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	PDE4C	Q08493	712 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	CABP1	Q9NZU7	370 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	STK3	Q13188	491 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	CBX1	P83916	185 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	GRIN2B	Q13224	1484 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	TOPBP1	Q92547	1522 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	OLFM4	Q6UX06	510 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	FCHSD2	O94868	740 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	SYNJ2	O15056	1496 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	KDM4A	O75164	1064 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.34	□□□□□ -0.27

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