RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 HIP1O00291 1037 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 SMC2O95347 1197 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 CEP63Q96MT8 703 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 AMPHP49418 695 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 SHTN1A0MZ66 631 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC181Q5TID7 509 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 RUNDC1Q96C34 613 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 MYZAPP0CAP1 466 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 PAF1Q8N7H5 531 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 CETN2P41208 172 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 SEPT6Q14141 434 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 CNTROBQ8N137 903 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 CBFA2T2O43439 604 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 HOOK3Q86VS8 718 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 VPS37DQ86XT2 251 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 DDX58O95786 925 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 ZWINTO95229 277 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 FAM114A2Q9NRY5 505 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 ESPNB1AK53 854 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf141Q5JVX7 400 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 SETSIPP0DME0 302 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 SMARCA4P51532 1647 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC7Q96M83 1385 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD1Q15327 319 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 C6orf163Q5TEZ5 329 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 BCL2L13Q9BXK5 485 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 POTEJP0CG39 1038 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 USH1CQ9Y6N9 552 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 COG3Q96JB2 828 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 FBXO3Q9UK99 471 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 FBXW7Q969H0 707 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 RNF214Q8ND24 703 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 FERMT1Q9BQL6 677 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 MROH2BQ7Z745 1585 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 TAOK3Q9H2K8 898 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD62A6NC57 917 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 GNAI1P63096 354 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 ZSCAN30Q86W11 494 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 IL27Q8NEV9 243 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 TNMDQ9H2S6 317 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 SWAP70Q9UH65 585 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 STAC3Q96MF2 364 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 LNPKQ9C0E8 428 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 EID1Q9Y6B2 187 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 PDE3AQ14432 1141 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 NEBLO76041 1014 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-209ENST00000612229 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-209ENST00000612229 ERC1Q8IUD2 1116 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-209ENST00000612229 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-209ENST00000612229 SPC24Q8NBT2 197 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-209ENST00000612229 GCC1Q96CN9 775 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-209ENST00000612229 APAF1O14727 1248 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-209ENST00000612229 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC6Q16204 474 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-209ENST00000612229 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-209ENST00000612229 BACH2Q9BYV9 841 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-209ENST00000612229 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-209ENST00000612229 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-209ENST00000612229 DNAAF4Q8WXU2 420 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-209ENST00000612229 RIPK4P57078 832 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-209ENST00000612229 FERP16591 822 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-209ENST00000612229 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-209ENST00000612229 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-209ENST00000612229 TMCO5BA8MYB1 307 aa8.2□□□□□ -1.1
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