RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600058.5

FCHO1-230, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2

Gene FCHO1, Length 910 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-230ENST00000600058 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.03■■□□□ 1.6
FCHO1-230ENST00000600058 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.03■■□□□ 1.6
FCHO1-230ENST00000600058 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.03■■□□□ 1.6
FCHO1-230ENST00000600058 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
FCHO1-230ENST00000600058 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.02■■□□□ 1.6
FCHO1-230ENST00000600058 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
FCHO1-230ENST00000600058 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
FCHO1-230ENST00000600058 TRAK1Q9UPV9 953 aa25■■□□□ 1.59
FCHO1-230ENST00000600058 DISP2A7MBM2 1401 aa25■■□□□ 1.59
FCHO1-230ENST00000600058 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
FCHO1-230ENST00000600058 FAM182BQ5T319 152 aa24.98■■□□□ 1.59
FCHO1-230ENST00000600058 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
FCHO1-230ENST00000600058 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.96■■□□□ 1.59
FCHO1-230ENST00000600058 ITSN1Q15811 1721 aa24.95■■□□□ 1.59
FCHO1-230ENST00000600058 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
FCHO1-230ENST00000600058 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
FCHO1-230ENST00000600058 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
FCHO1-230ENST00000600058 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
FCHO1-230ENST00000600058 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.91■■□□□ 1.58
FCHO1-230ENST00000600058 KIAA0232Q92628 1395 aa24.9■■□□□ 1.58
FCHO1-230ENST00000600058 ATP7BP35670 1465 aa24.89■■□□□ 1.58
FCHO1-230ENST00000600058 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
FCHO1-230ENST00000600058 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
FCHO1-230ENST00000600058 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.88■■□□□ 1.57
FCHO1-230ENST00000600058 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.87■■□□□ 1.57
FCHO1-230ENST00000600058 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.87■■□□□ 1.57
FCHO1-230ENST00000600058 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.86■■□□□ 1.57
FCHO1-230ENST00000600058 CHRNA2Q15822 529 aa24.86■■□□□ 1.57
FCHO1-230ENST00000600058 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.86■■□□□ 1.57
FCHO1-230ENST00000600058 STAC3Q96MF2 364 aa24.86■■□□□ 1.57
FCHO1-230ENST00000600058 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.85■■□□□ 1.57
FCHO1-230ENST00000600058 TRIM37O94972 964 aa24.85■■□□□ 1.57
FCHO1-230ENST00000600058 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
FCHO1-230ENST00000600058 STRN4Q9NRL3 753 aa24.84■■□□□ 1.57
FCHO1-230ENST00000600058 RREB1Q92766 1687 aa24.83■■□□□ 1.57
FCHO1-230ENST00000600058 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.81■■□□□ 1.56
FCHO1-230ENST00000600058 APBA3O96018 575 aa24.81■■□□□ 1.56
FCHO1-230ENST00000600058 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
FCHO1-230ENST00000600058 SSH2Q76I76 1423 aa24.8■■□□□ 1.56
FCHO1-230ENST00000600058 BARGINQ6ZT62 677 aa24.8■■□□□ 1.56
FCHO1-230ENST00000600058 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
FCHO1-230ENST00000600058 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.79■■□□□ 1.56
FCHO1-230ENST00000600058 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.79■■□□□ 1.56
FCHO1-230ENST00000600058 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.78■■□□□ 1.56
FCHO1-230ENST00000600058 USP35Q9P2H5 1018 aa24.78■■□□□ 1.56
FCHO1-230ENST00000600058 PDE3BQ13370 1112 aa24.77■■□□□ 1.56
FCHO1-230ENST00000600058 CDK19Q9BWU1 502 aa24.77■■□□□ 1.56
FCHO1-230ENST00000600058 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.77■■□□□ 1.56
FCHO1-230ENST00000600058 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.76■■□□□ 1.55
FCHO1-230ENST00000600058 EVA1CP58658 441 aa24.76■■□□□ 1.55
FCHO1-230ENST00000600058 ACEP12821 1306 aa24.76■■□□□ 1.55
FCHO1-230ENST00000600058 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.75■■□□□ 1.55
FCHO1-230ENST00000600058 CPDO75976 1380 aa24.75■■□□□ 1.55
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.74■■□□□ 1.55
FCHO1-230ENST00000600058 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.73■■□□□ 1.55
FCHO1-230ENST00000600058 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
FCHO1-230ENST00000600058 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.72■■□□□ 1.55
FCHO1-230ENST00000600058 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
FCHO1-230ENST00000600058 USP19O94966 1318 aa24.71■■□□□ 1.55
FCHO1-230ENST00000600058 NBPF14Q5TI25 921 aa24.71■■□□□ 1.55
FCHO1-230ENST00000600058 ABTB2Q8N961 1025 aa24.71■■□□□ 1.55
FCHO1-230ENST00000600058 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.7■■□□□ 1.54
FCHO1-230ENST00000600058 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
FCHO1-230ENST00000600058 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
FCHO1-230ENST00000600058 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
FCHO1-230ENST00000600058 GCP02774 474 aa24.65■■□□□ 1.54
FCHO1-230ENST00000600058 NLRP13Q86W25 1043 aa24.65■■□□□ 1.54
FCHO1-230ENST00000600058 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
FCHO1-230ENST00000600058 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.64■■□□□ 1.53
FCHO1-230ENST00000600058 PEAK1Q9H792 1746 aa24.64■■□□□ 1.53
FCHO1-230ENST00000600058 SPON1Q9HCB6 807 aa24.63■■□□□ 1.53
FCHO1-230ENST00000600058 CRB1P82279 1406 aa24.62■■□□□ 1.53
FCHO1-230ENST00000600058 YY1P25490 414 aa24.62■■□□□ 1.53
FCHO1-230ENST00000600058 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
FCHO1-230ENST00000600058 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.61■■□□□ 1.53
FCHO1-230ENST00000600058 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.61■■□□□ 1.53
FCHO1-230ENST00000600058 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.61■■□□□ 1.53
FCHO1-230ENST00000600058 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.61■■□□□ 1.53
FCHO1-230ENST00000600058 SBF2Q86WG5 1849 aa24.61■■□□□ 1.53
FCHO1-230ENST00000600058 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
FCHO1-230ENST00000600058 KCNQ2O43526 872 aa24.59■■□□□ 1.53
FCHO1-230ENST00000600058 LRRC37A3O60309 1634 aa24.59■■□□□ 1.53
FCHO1-230ENST00000600058 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.58■■□□□ 1.53
FCHO1-230ENST00000600058 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
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FCHO1-230ENST00000600058 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.56■■□□□ 1.52
FCHO1-230ENST00000600058 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.56■■□□□ 1.52
FCHO1-230ENST00000600058 PLSCR1O15162 318 aa24.55■■□□□ 1.52
FCHO1-230ENST00000600058 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
FCHO1-230ENST00000600058 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.54■■□□□ 1.52
FCHO1-230ENST00000600058 USP6P35125 1406 aa24.54■■□□□ 1.52
FCHO1-230ENST00000600058 CABP2Q9NPB3 220 aa24.54■■□□□ 1.52
FCHO1-230ENST00000600058 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.53■■□□□ 1.52
FCHO1-230ENST00000600058 COL18A1P39060 1754 aa24.53■■□□□ 1.52
FCHO1-230ENST00000600058 CASZ1Q86V15 1759 aa24.53■■□□□ 1.52
FCHO1-230ENST00000600058 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.53■■□□□ 1.52
FCHO1-230ENST00000600058 DDB1Q16531 1140 aa24.53■■□□□ 1.52
FCHO1-230ENST00000600058 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.52■■□□□ 1.52
FCHO1-230ENST00000600058 NLRP6P59044 892 aa24.52■■□□□ 1.52
FCHO1-230ENST00000600058 PIK3C2AO00443 1686 aa24.5■■□□□ 1.51
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