RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600000.1

TIMM44-211, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM44, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-211ENST00000600000 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
TIMM44-211ENST00000600000 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.87■■□□□ 1.89
TIMM44-211ENST00000600000 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.87■■□□□ 1.89
TIMM44-211ENST00000600000 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
TIMM44-211ENST00000600000 NRAPQ86VF7 1730 aa26.86■■□□□ 1.89
TIMM44-211ENST00000600000 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
TIMM44-211ENST00000600000 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
TIMM44-211ENST00000600000 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.88
TIMM44-211ENST00000600000 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.82■■□□□ 1.88
TIMM44-211ENST00000600000 ACEP12821 1306 aa26.82■■□□□ 1.88
TIMM44-211ENST00000600000 FAM83GA6ND36 823 aa26.8■■□□□ 1.88
TIMM44-211ENST00000600000 CABP2Q9NPB3 220 aa26.8■■□□□ 1.88
TIMM44-211ENST00000600000 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.8■■□□□ 1.88
TIMM44-211ENST00000600000 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.8■■□□□ 1.88
TIMM44-211ENST00000600000 A0A0G2JS52 829 aa26.78■■□□□ 1.88
TIMM44-211ENST00000600000 MYT1Q01538 1121 aa26.78■■□□□ 1.88
TIMM44-211ENST00000600000 EP400Q96L91 3159 aa26.77■■□□□ 1.88
TIMM44-211ENST00000600000 BTG4Q9NY30 223 aa26.77■■□□□ 1.88
TIMM44-211ENST00000600000 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
TIMM44-211ENST00000600000 VPS72Q15906 364 aa26.76■■□□□ 1.87
TIMM44-211ENST00000600000 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.75■■□□□ 1.87
TIMM44-211ENST00000600000 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.75■■□□□ 1.87
TIMM44-211ENST00000600000 TONSLQ96HA7 1378 aa26.72■■□□□ 1.87
TIMM44-211ENST00000600000 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.72■■□□□ 1.87
TIMM44-211ENST00000600000 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
TIMM44-211ENST00000600000 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.71■■□□□ 1.87
TIMM44-211ENST00000600000 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.71■■□□□ 1.87
TIMM44-211ENST00000600000 ABTB2Q8N961 1025 aa26.71■■□□□ 1.87
TIMM44-211ENST00000600000 KIAA0232Q92628 1395 aa26.71■■□□□ 1.87
TIMM44-211ENST00000600000 EVC2Q86UK5 1308 aa26.7■■□□□ 1.87
TIMM44-211ENST00000600000 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
TIMM44-211ENST00000600000 CHRNA2Q15822 529 aa26.7■■□□□ 1.86
TIMM44-211ENST00000600000 AKAP12Q02952 1782 aa26.67■■□□□ 1.86
TIMM44-211ENST00000600000 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
TIMM44-211ENST00000600000 CABP1Q9NZU7 370 aa26.67■■□□□ 1.86
TIMM44-211ENST00000600000 STRN4Q9NRL3 753 aa26.66■■□□□ 1.86
TIMM44-211ENST00000600000 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.63■■□□□ 1.85
TIMM44-211ENST00000600000 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.63■■□□□ 1.85
TIMM44-211ENST00000600000 USP6P35125 1406 aa26.63■■□□□ 1.85
TIMM44-211ENST00000600000 PIK3C2AO00443 1686 aa26.62■■□□□ 1.85
TIMM44-211ENST00000600000 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.6■■□□□ 1.85
TIMM44-211ENST00000600000 NLRP13Q86W25 1043 aa26.59■■□□□ 1.85
TIMM44-211ENST00000600000 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.59■■□□□ 1.85
TIMM44-211ENST00000600000 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.59■■□□□ 1.85
TIMM44-211ENST00000600000 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.58■■□□□ 1.85
TIMM44-211ENST00000600000 USP35Q9P2H5 1018 aa26.58■■□□□ 1.85
TIMM44-211ENST00000600000 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.57■■□□□ 1.84
TIMM44-211ENST00000600000 EVA1CP58658 441 aa26.57■■□□□ 1.84
TIMM44-211ENST00000600000 USP19O94966 1318 aa26.57■■□□□ 1.84
TIMM44-211ENST00000600000 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
TIMM44-211ENST00000600000 NLRP6P59044 892 aa26.56■■□□□ 1.84
TIMM44-211ENST00000600000 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
TIMM44-211ENST00000600000 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.56■■□□□ 1.84
TIMM44-211ENST00000600000 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
TIMM44-211ENST00000600000 CCDC125Q86Z20 511 aa26.55■■□□□ 1.84
TIMM44-211ENST00000600000 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.54■■□□□ 1.84
TIMM44-211ENST00000600000 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
TIMM44-211ENST00000600000 GCP02774 474 aa26.53■■□□□ 1.84
TIMM44-211ENST00000600000 FAM182BQ5T319 152 aa26.53■■□□□ 1.84
TIMM44-211ENST00000600000 SSH2Q76I76 1423 aa26.53■■□□□ 1.84
TIMM44-211ENST00000600000 RGPD5Q99666 1765 aa26.53■■□□□ 1.84
TIMM44-211ENST00000600000 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.52■■□□□ 1.84
TIMM44-211ENST00000600000 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.52■■□□□ 1.84
TIMM44-211ENST00000600000 SLIT3O75094 1523 aa26.51■■□□□ 1.83
TIMM44-211ENST00000600000 CPDO75976 1380 aa26.51■■□□□ 1.83
TIMM44-211ENST00000600000 SOX12O15370 315 aa26.51■■□□□ 1.83
TIMM44-211ENST00000600000 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.51■■□□□ 1.83
TIMM44-211ENST00000600000 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
TIMM44-211ENST00000600000 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
TIMM44-211ENST00000600000 TMC1Q8TDI8 760 aa26.48■■□□□ 1.83
TIMM44-211ENST00000600000 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.47■■□□□ 1.83
TIMM44-211ENST00000600000 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.47■■□□□ 1.83
TIMM44-211ENST00000600000 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.47■■□□□ 1.83
TIMM44-211ENST00000600000 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
TIMM44-211ENST00000600000 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
TIMM44-211ENST00000600000 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
TIMM44-211ENST00000600000 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
TIMM44-211ENST00000600000 COL18A1P39060 1754 aa26.43■■□□□ 1.82
TIMM44-211ENST00000600000 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.42■■□□□ 1.82
TIMM44-211ENST00000600000 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
TIMM44-211ENST00000600000 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.41■■□□□ 1.82
TIMM44-211ENST00000600000 LTN1O94822 1766 aa26.41■■□□□ 1.82
TIMM44-211ENST00000600000 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.4■■□□□ 1.82
TIMM44-211ENST00000600000 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.4■■□□□ 1.82
TIMM44-211ENST00000600000 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
TIMM44-211ENST00000600000 BAG6P46379 1132 aa26.39■■□□□ 1.82
TIMM44-211ENST00000600000 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
TIMM44-211ENST00000600000 CRB1P82279 1406 aa26.38■■□□□ 1.81
TIMM44-211ENST00000600000 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.37■■□□□ 1.81
TIMM44-211ENST00000600000 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.37■■□□□ 1.81
TIMM44-211ENST00000600000 PDE3BQ13370 1112 aa26.37■■□□□ 1.81
TIMM44-211ENST00000600000 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.37■■□□□ 1.81
TIMM44-211ENST00000600000 NFAT5O94916 1531 aa26.36■■□□□ 1.81
TIMM44-211ENST00000600000 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.36■■□□□ 1.81
TIMM44-211ENST00000600000 BARGINQ6ZT62 677 aa26.36■■□□□ 1.81
TIMM44-211ENST00000600000 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.36■■□□□ 1.81
TIMM44-211ENST00000600000 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.36■■□□□ 1.81
TIMM44-211ENST00000600000 USP54Q70EL1 1684 aa26.35■■□□□ 1.81
TIMM44-211ENST00000600000 NME9Q86XW9 330 aa26.34■■□□□ 1.81
TIMM44-211ENST00000600000 LRRC37A3O60309 1634 aa26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms