RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.42■■□□□ 1.66
USP3-AS1-210ENST00000561256 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
USP3-AS1-210ENST00000561256 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
USP3-AS1-210ENST00000561256 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.4■■□□□ 1.66
USP3-AS1-210ENST00000561256 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.36■■□□□ 1.65
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.36■■□□□ 1.65
USP3-AS1-210ENST00000561256 LRP5O75197 1615 aa25.35■■□□□ 1.65
USP3-AS1-210ENST00000561256 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.35■■□□□ 1.65
USP3-AS1-210ENST00000561256 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.34■■□□□ 1.65
USP3-AS1-210ENST00000561256 STAC3Q96MF2 364 aa25.33■■□□□ 1.65
USP3-AS1-210ENST00000561256 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.32■■□□□ 1.64
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM182BQ5T319 152 aa25.32■■□□□ 1.64
USP3-AS1-210ENST00000561256 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
USP3-AS1-210ENST00000561256 ITSN1Q15811 1721 aa25.3■■□□□ 1.64
USP3-AS1-210ENST00000561256 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.29■■□□□ 1.64
USP3-AS1-210ENST00000561256 ATP7BP35670 1465 aa25.29■■□□□ 1.64
USP3-AS1-210ENST00000561256 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
USP3-AS1-210ENST00000561256 HRCP23327 699 aa25.28■■□□□ 1.64
USP3-AS1-210ENST00000561256 KIAA0232Q92628 1395 aa25.28■■□□□ 1.64
USP3-AS1-210ENST00000561256 CHRNA2Q15822 529 aa25.26■■□□□ 1.63
USP3-AS1-210ENST00000561256 STRN4Q9NRL3 753 aa25.25■■□□□ 1.63
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.25■■□□□ 1.63
USP3-AS1-210ENST00000561256 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
USP3-AS1-210ENST00000561256 DISP2A7MBM2 1401 aa25.23■■□□□ 1.63
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
USP3-AS1-210ENST00000561256 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.23■■□□□ 1.63
USP3-AS1-210ENST00000561256 CDK19Q9BWU1 502 aa25.23■■□□□ 1.63
USP3-AS1-210ENST00000561256 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
USP3-AS1-210ENST00000561256 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.2■■□□□ 1.62
USP3-AS1-210ENST00000561256 ACEP12821 1306 aa25.19■■□□□ 1.62
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRIM37O94972 964 aa25.19■■□□□ 1.62
USP3-AS1-210ENST00000561256 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
USP3-AS1-210ENST00000561256 USP35Q9P2H5 1018 aa25.19■■□□□ 1.62
USP3-AS1-210ENST00000561256 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
USP3-AS1-210ENST00000561256 EVA1CP58658 441 aa25.18■■□□□ 1.62
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.18■■□□□ 1.62
USP3-AS1-210ENST00000561256 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.17■■□□□ 1.62
USP3-AS1-210ENST00000561256 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.17■■□□□ 1.62
USP3-AS1-210ENST00000561256 SSH2Q76I76 1423 aa25.15■■□□□ 1.62
USP3-AS1-210ENST00000561256 ABTB2Q8N961 1025 aa25.15■■□□□ 1.62
USP3-AS1-210ENST00000561256 APBA3O96018 575 aa25.14■■□□□ 1.62
USP3-AS1-210ENST00000561256 PDE3BQ13370 1112 aa25.14■■□□□ 1.62
USP3-AS1-210ENST00000561256 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.14■■□□□ 1.62
USP3-AS1-210ENST00000561256 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.13■■□□□ 1.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 BARGINQ6ZT62 677 aa25.13■■□□□ 1.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.13■■□□□ 1.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.11■■□□□ 1.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.11■■□□□ 1.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.1■■□□□ 1.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 CPDO75976 1380 aa25.09■■□□□ 1.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.09■■□□□ 1.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 USP19O94966 1318 aa25.08■■□□□ 1.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.07■■□□□ 1.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 NLRP13Q86W25 1043 aa25.07■■□□□ 1.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.06■■□□□ 1.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.06■■□□□ 1.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 GCP02774 474 aa25.04■■□□□ 1.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 RREB1Q92766 1687 aa25.04■■□□□ 1.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 NBPF14Q5TI25 921 aa25.02■■□□□ 1.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 CABP2Q9NPB3 220 aa25.02■■□□□ 1.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 NUP188Q5SRE5 1749 aa25■■□□□ 1.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25■■□□□ 1.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 CRB1P82279 1406 aa24.98■■□□□ 1.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 NLRP6P59044 892 aa24.96■■□□□ 1.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.96■■□□□ 1.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 USP6P35125 1406 aa24.95■■□□□ 1.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 CABP1Q9NZU7 370 aa24.95■■□□□ 1.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.94■■□□□ 1.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.94■■□□□ 1.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.94■■□□□ 1.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.93■■□□□ 1.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLIT3O75094 1523 aa24.92■■□□□ 1.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.91■■□□□ 1.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 DDB1Q16531 1140 aa24.9■■□□□ 1.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPON1Q9HCB6 807 aa24.9■■□□□ 1.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 LRRC37A3O60309 1634 aa24.9■■□□□ 1.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 PEAK1Q9H792 1746 aa24.89■■□□□ 1.57
USP3-AS1-210ENST00000561256 EVC2Q86UK5 1308 aa24.87■■□□□ 1.57
USP3-AS1-210ENST00000561256 PIK3C2AO00443 1686 aa24.87■■□□□ 1.57
USP3-AS1-210ENST00000561256 KCNQ2O43526 872 aa24.86■■□□□ 1.57
USP3-AS1-210ENST00000561256 PLSCR1O15162 318 aa24.85■■□□□ 1.57
USP3-AS1-210ENST00000561256 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
USP3-AS1-210ENST00000561256 COL18A1P39060 1754 aa24.85■■□□□ 1.57
USP3-AS1-210ENST00000561256 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.85■■□□□ 1.57
USP3-AS1-210ENST00000561256 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.85■■□□□ 1.57
USP3-AS1-210ENST00000561256 SBF2Q86WG5 1849 aa24.84■■□□□ 1.57
USP3-AS1-210ENST00000561256 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms