RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 SEMA3EO15041 775 aa8.63□□□□□ -1.03
FAM227B-211ENST00000560557 HOXA2O43364 376 aa8.63□□□□□ -1.03
FAM227B-211ENST00000560557 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
FAM227B-211ENST00000560557 GUCA2AQ02747 115 aa8.63□□□□□ -1.03
FAM227B-211ENST00000560557 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.63□□□□□ -1.03
FAM227B-211ENST00000560557 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.63□□□□□ -1.03
FAM227B-211ENST00000560557 SLURP2P0DP57 97 aa8.62□□□□□ -1.03
FAM227B-211ENST00000560557 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
FAM227B-211ENST00000560557 USP46P62068 366 aa8.62□□□□□ -1.03
FAM227B-211ENST00000560557 BAP1Q92560 729 aa8.62□□□□□ -1.03
FAM227B-211ENST00000560557 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
FAM227B-211ENST00000560557 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
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FAM227B-211ENST00000560557 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
FAM227B-211ENST00000560557 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.61□□□□□ -1.03
FAM227B-211ENST00000560557 MSTNO14793 375 aa8.6□□□□□ -1.03
FAM227B-211ENST00000560557 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.6□□□□□ -1.03
FAM227B-211ENST00000560557 RETREG3Q86VR2 466 aa8.6□□□□□ -1.03
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FAM227B-211ENST00000560557 ZNF511Q8NB15 262 aa8.59□□□□□ -1.03
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FAM227B-211ENST00000560557 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.59□□□□□ -1.03
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FAM227B-211ENST00000560557 MS4A1P11836 297 aa8.56□□□□□ -1.04
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FAM227B-211ENST00000560557 Q8N3U1 123 aa8.56□□□□□ -1.04
FAM227B-211ENST00000560557 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
FAM227B-211ENST00000560557 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.56□□□□□ -1.04
FAM227B-211ENST00000560557 NR3C2P08235 984 aa8.55□□□□□ -1.04
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FAM227B-211ENST00000560557 MEIOBQ8N635 442 aa8.55□□□□□ -1.04
FAM227B-211ENST00000560557 CDK15Q96Q40 435 aa8.55□□□□□ -1.04
FAM227B-211ENST00000560557 UPP2O95045 317 aa8.54□□□□□ -1.04
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FAM227B-211ENST00000560557 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
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FAM227B-211ENST00000560557 KCNH2Q12809 1159 aa8.52□□□□□ -1.05
FAM227B-211ENST00000560557 DCAF5Q96JK2 942 aa8.52□□□□□ -1.05
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FAM227B-211ENST00000560557 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.5□□□□□ -1.05
FAM227B-211ENST00000560557 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
FAM227B-211ENST00000560557 NR5A1Q13285 461 aa8.49□□□□□ -1.05
FAM227B-211ENST00000560557 ARID5BQ14865 1188 aa8.49□□□□□ -1.05
FAM227B-211ENST00000560557 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.48□□□□□ -1.05
FAM227B-211ENST00000560557 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
FAM227B-211ENST00000560557 TTLL8A6PVC2 850 aa8.47□□□□□ -1.05
FAM227B-211ENST00000560557 ADAMTS2O95450 1211 aa8.47□□□□□ -1.05
FAM227B-211ENST00000560557 GRM5P41594 1212 aa8.47□□□□□ -1.05
FAM227B-211ENST00000560557 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.47□□□□□ -1.05
FAM227B-211ENST00000560557 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.47□□□□□ -1.05
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FAM227B-211ENST00000560557 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
FAM227B-211ENST00000560557 SLC35F4A4IF30 521 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM227B-211ENST00000560557 SPTLC1O15269 473 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM227B-211ENST00000560557 ITGA6P23229 1130 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM227B-211ENST00000560557 SV2AQ7L0J3 742 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM227B-211ENST00000560557 FOXJ1Q92949 421 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM227B-211ENST00000560557 CDC14CA4D256 554 aa8.44□□□□□ -1.06
FAM227B-211ENST00000560557 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.44□□□□□ -1.06
FAM227B-211ENST00000560557 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
FAM227B-211ENST00000560557 FDX1P10109 184 aa8.44□□□□□ -1.06
FAM227B-211ENST00000560557 MAP3K10Q02779 954 aa8.44□□□□□ -1.06
FAM227B-211ENST00000560557 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.44□□□□□ -1.06
FAM227B-211ENST00000560557 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.43□□□□□ -1.06
FAM227B-211ENST00000560557 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
FAM227B-211ENST00000560557 P3H3Q8IVL6 736 aa8.43□□□□□ -1.06
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FAM227B-211ENST00000560557 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.42□□□□□ -1.06
FAM227B-211ENST00000560557 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
FAM227B-211ENST00000560557 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.4□□□□□ -1.06
FAM227B-211ENST00000560557 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.4□□□□□ -1.06
FAM227B-211ENST00000560557 PRR7Q8TB68 274 aa8.39□□□□□ -1.07
FAM227B-211ENST00000560557 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.39□□□□□ -1.07
FAM227B-211ENST00000560557 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.39□□□□□ -1.07
FAM227B-211ENST00000560557 BAG6P46379 1132 aa8.38□□□□□ -1.07
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FAM227B-211ENST00000560557 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.38□□□□□ -1.07
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa8.38□□□□□ -1.07
FAM227B-211ENST00000560557 GAS6Q14393 721 aa8.37□□□□□ -1.07
FAM227B-211ENST00000560557 SPINT1O43278 529 aa8.36□□□□□ -1.07
FAM227B-211ENST00000560557 FSHRP23945 695 aa8.36□□□□□ -1.07
FAM227B-211ENST00000560557 CTHP32929 405 aa8.36□□□□□ -1.07
FAM227B-211ENST00000560557 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
FAM227B-211ENST00000560557 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
FAM227B-211ENST00000560557 MAP2K5Q13163 448 aa8.35□□□□□ -1.07
FAM227B-211ENST00000560557 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.35□□□□□ -1.07
FAM227B-211ENST00000560557 PODNQ7Z5L7 613 aa8.34□□□□□ -1.07
FAM227B-211ENST00000560557 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.34□□□□□ -1.07
FAM227B-211ENST00000560557 FURINP09958 794 aa8.33□□□□□ -1.08
FAM227B-211ENST00000560557 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.32□□□□□ -1.08
FAM227B-211ENST00000560557 AGERQ15109 404 aa8.32□□□□□ -1.08
FAM227B-211ENST00000560557 LYPD8Q6UX82 237 aa8.32□□□□□ -1.08
FAM227B-211ENST00000560557 MAP10Q9P2G4 905 aa8.32□□□□□ -1.08
FAM227B-211ENST00000560557 IRF6O14896 467 aa8.31□□□□□ -1.08
FAM227B-211ENST00000560557 CBLBQ13191 982 aa8.31□□□□□ -1.08
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