RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 NSD2O96028 1365 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 PSME1Q06323 249 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 FOXO3O43524 673 aa23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.26■■□□□ 1.31
USP3-AS1-201ENST00000558831 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.26■■□□□ 1.31
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP2R1AP30153 589 aa23.26■■□□□ 1.31
USP3-AS1-201ENST00000558831 FYB1O15117 783 aa23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-201ENST00000558831 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-201ENST00000558831 SSH2Q76I76 1423 aa23.24■■□□□ 1.31
USP3-AS1-201ENST00000558831 BRINP3Q76B58 766 aa23.24■■□□□ 1.31
USP3-AS1-201ENST00000558831 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.22■■□□□ 1.31
USP3-AS1-201ENST00000558831 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.22■■□□□ 1.31
USP3-AS1-201ENST00000558831 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
USP3-AS1-201ENST00000558831 NME9Q86XW9 330 aa23.21■■□□□ 1.31
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 TOM1O60784 492 aa23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 COG3Q96JB2 828 aa23.18■■□□□ 1.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 CERKQ8TCT0 537 aa23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABTB2Q8N961 1025 aa23.16■■□□□ 1.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.14■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIK3C2AO00443 1686 aa23.13■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.13■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP31Q70CQ4 1352 aa23.13■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 PXDNQ92626 1479 aa23.12■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.12■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 NLRP6P59044 892 aa23.12■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 SBNO1A3KN83 1393 aa23.12■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.11■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.11■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 MTHFSP49914 203 aa23.11■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.09■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIP4K2BP78356 416 aa23.08■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.08■■□□□ 1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP54Q70EL1 1684 aa23.07■■□□□ 1.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 CFAP53Q96M91 514 aa23.07■■□□□ 1.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 ALS2Q96Q42 1657 aa23.06■■□□□ 1.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.06■■□□□ 1.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGEF10O15013 1369 aa23.05■■□□□ 1.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 FBLN1P23142 703 aa23.05■■□□□ 1.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.05■■□□□ 1.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 SOX12O15370 315 aa23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-201ENST00000558831 POLKQ9UBT6 870 aa23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23■■□□□ 1.27
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP19O94966 1318 aa22.99■■□□□ 1.27
USP3-AS1-201ENST00000558831 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
USP3-AS1-201ENST00000558831 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.98■■□□□ 1.27
USP3-AS1-201ENST00000558831 PHLPP1O60346 1717 aa22.97■■□□□ 1.27
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLIT3O75094 1523 aa22.97■■□□□ 1.27
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLEKHG5O94827 1062 aa22.96■■□□□ 1.27
USP3-AS1-201ENST00000558831 GCP02774 474 aa22.96■■□□□ 1.27
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
USP3-AS1-201ENST00000558831 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.94■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUDCQ9Y266 331 aa22.94■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 NFAT5O94916 1531 aa22.93■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.93■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 SHPRHQ149N8 1683 aa22.93■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 AMPHP49418 695 aa22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 INSRP06213 1382 aa22.9■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 LTN1O94822 1766 aa22.89■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.89■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 FLT4P35916 1363 aa22.89■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.89■■□□□ 1.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 RTL1A6NKG5 1358 aa22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms