RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 ALS2Q96Q42 1657 aa26.41■■□□□ 1.82
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TSPAN3-204ENST00000558394 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
TSPAN3-204ENST00000558394 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.4■■□□□ 1.82
TSPAN3-204ENST00000558394 DISP2A7MBM2 1401 aa26.39■■□□□ 1.82
TSPAN3-204ENST00000558394 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
TSPAN3-204ENST00000558394 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
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TSPAN3-204ENST00000558394 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
TSPAN3-204ENST00000558394 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.36■■□□□ 1.81
TSPAN3-204ENST00000558394 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.36■■□□□ 1.81
TSPAN3-204ENST00000558394 TRIM37O94972 964 aa26.35■■□□□ 1.81
TSPAN3-204ENST00000558394 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.35■■□□□ 1.81
TSPAN3-204ENST00000558394 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.33■■□□□ 1.81
TSPAN3-204ENST00000558394 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
TSPAN3-204ENST00000558394 APBA3O96018 575 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPAN3-204ENST00000558394 STRN4Q9NRL3 753 aa26.31■■□□□ 1.8
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TSPAN3-204ENST00000558394 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.31■■□□□ 1.8
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TSPAN3-204ENST00000558394 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.3■■□□□ 1.8
TSPAN3-204ENST00000558394 KIAA0232Q92628 1395 aa26.28■■□□□ 1.8
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TSPAN3-204ENST00000558394 PDE3BQ13370 1112 aa26.27■■□□□ 1.8
TSPAN3-204ENST00000558394 CHRNA2Q15822 529 aa26.27■■□□□ 1.8
TSPAN3-204ENST00000558394 USP35Q9P2H5 1018 aa26.27■■□□□ 1.8
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TSPAN3-204ENST00000558394 ITSN1Q15811 1721 aa26.25■■□□□ 1.79
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TSPAN3-204ENST00000558394 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.2■■□□□ 1.78
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TSPAN3-204ENST00000558394 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.16■■□□□ 1.78
TSPAN3-204ENST00000558394 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.15■■□□□ 1.78
TSPAN3-204ENST00000558394 SPON1Q9HCB6 807 aa26.15■■□□□ 1.78
TSPAN3-204ENST00000558394 STAC3Q96MF2 364 aa26.14■■□□□ 1.78
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TSPAN3-204ENST00000558394 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.08■■□□□ 1.77
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TSPAN3-204ENST00000558394 NLRP13Q86W25 1043 aa26.04■■□□□ 1.76
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TSPAN3-204ENST00000558394 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.03■■□□□ 1.76
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TSPAN3-204ENST00000558394 OVOS2Q6IE36 1432 aa26■■□□□ 1.75
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TSPAN3-204ENST00000558394 GCP02774 474 aa26■■□□□ 1.75
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TSPAN3-204ENST00000558394 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TSPAN3-204ENST00000558394 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.93■■□□□ 1.74
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TSPAN3-204ENST00000558394 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
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TSPAN3-204ENST00000558394 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.88■■□□□ 1.73
TSPAN3-204ENST00000558394 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.88■■□□□ 1.73
TSPAN3-204ENST00000558394 ZBTB7AO95365 584 aa25.87■■□□□ 1.73
TSPAN3-204ENST00000558394 CASZ1Q86V15 1759 aa25.87■■□□□ 1.73
TSPAN3-204ENST00000558394 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
TSPAN3-204ENST00000558394 CABP2Q9NPB3 220 aa25.86■■□□□ 1.73
TSPAN3-204ENST00000558394 AKAP12Q02952 1782 aa25.84■■□□□ 1.73
TSPAN3-204ENST00000558394 STK32BQ9NY57 414 aa25.84■■□□□ 1.73
TSPAN3-204ENST00000558394 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
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