RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.57■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.57■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.55■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 ALS2Q96Q42 1657 aa20.54■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 KCNQ2O43526 872 aa20.53■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 KIAA0232Q92628 1395 aa20.53■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 RREB1Q92766 1687 aa20.53■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 ADGRB2O60241 1585 aa20.52■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.52■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 SPON1Q9HCB6 807 aa20.52■□□□□ 0.88
CS-231ENST00000552222 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa20.51■□□□□ 0.87
CS-231ENST00000552222 SIRT1Q96EB6 747 aa20.51■□□□□ 0.87
CS-231ENST00000552222 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CS-231ENST00000552222 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.5■□□□□ 0.87
CS-231ENST00000552222 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CS-231ENST00000552222 POGKQ9P215 609 aa20.5■□□□□ 0.87
CS-231ENST00000552222 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.49■□□□□ 0.87
CS-231ENST00000552222 NBPF14Q5TI25 921 aa20.49■□□□□ 0.87
CS-231ENST00000552222 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CS-231ENST00000552222 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.47■□□□□ 0.87
CS-231ENST00000552222 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.47■□□□□ 0.87
CS-231ENST00000552222 PDE3BQ13370 1112 aa20.47■□□□□ 0.87
CS-231ENST00000552222 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CS-231ENST00000552222 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.47■□□□□ 0.87
CS-231ENST00000552222 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CS-231ENST00000552222 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.46■□□□□ 0.87
CS-231ENST00000552222 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.45■□□□□ 0.86
CS-231ENST00000552222 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CS-231ENST00000552222 ZBTB7AO95365 584 aa20.44■□□□□ 0.86
CS-231ENST00000552222 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.44■□□□□ 0.86
CS-231ENST00000552222 NRKQ7Z2Y5 1582 aa20.42■□□□□ 0.86
CS-231ENST00000552222 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.42■□□□□ 0.86
CS-231ENST00000552222 EVA1CP58658 441 aa20.42■□□□□ 0.86
CS-231ENST00000552222 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.42■□□□□ 0.86
CS-231ENST00000552222 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CS-231ENST00000552222 SSH2Q76I76 1423 aa20.41■□□□□ 0.86
CS-231ENST00000552222 UTRNP46939 3433 aa20.4■□□□□ 0.86
CS-231ENST00000552222 BARGINQ6ZT62 677 aa20.4■□□□□ 0.86
CS-231ENST00000552222 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CS-231ENST00000552222 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CS-231ENST00000552222 PTGER2P43116 358 aa20.38■□□□□ 0.85
CS-231ENST00000552222 MYOM1P52179 1685 aa20.38■□□□□ 0.85
CS-231ENST00000552222 PROM2Q8N271 834 aa20.37■□□□□ 0.85
CS-231ENST00000552222 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.37■□□□□ 0.85
CS-231ENST00000552222 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.36■□□□□ 0.85
CS-231ENST00000552222 C1QTNF8P60827 252 aa20.35■□□□□ 0.85
CS-231ENST00000552222 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CS-231ENST00000552222 DLC1Q96QB1 1528 aa20.35■□□□□ 0.85
CS-231ENST00000552222 CASZ1Q86V15 1759 aa20.35■□□□□ 0.85
CS-231ENST00000552222 ADGRB1O14514 1584 aa20.34■□□□□ 0.85
CS-231ENST00000552222 IFFO2Q5TF58 517 aa20.34■□□□□ 0.85
CS-231ENST00000552222 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CS-231ENST00000552222 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.33■□□□□ 0.85
CS-231ENST00000552222 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CS-231ENST00000552222 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CS-231ENST00000552222 SYT17Q9BSW7 474 aa20.31■□□□□ 0.84
CS-231ENST00000552222 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.31■□□□□ 0.84
CS-231ENST00000552222 PEAK1Q9H792 1746 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-231ENST00000552222 ATP7BP35670 1465 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-231ENST00000552222 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-231ENST00000552222 ACEP12821 1306 aa20.27■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 PLSCR1O15162 318 aa20.26■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 ABTB2Q8N961 1025 aa20.26■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 CDK19Q9BWU1 502 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 OVOS2Q6IE36 1432 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 SBF2Q86WG5 1849 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 GCP02774 474 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 LRRC37A3O60309 1634 aa20.22■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 DDB1Q16531 1140 aa20.21■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 TXNRD1Q16881 649 aa20.21■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 USP19O94966 1318 aa20.21■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 CPDO75976 1380 aa20.21■□□□□ 0.83
CS-231ENST00000552222 SLC15A2Q16348 729 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-231ENST00000552222 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-231ENST00000552222 STK32BQ9NY57 414 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-231ENST00000552222 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CS-231ENST00000552222 CRB1P82279 1406 aa20.19■□□□□ 0.82
CS-231ENST00000552222 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.18■□□□□ 0.82
CS-231ENST00000552222 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.17■□□□□ 0.82
CS-231ENST00000552222 ITSN1Q15811 1721 aa20.16■□□□□ 0.82
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