RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544253.1

ANKRD49-208, Transcript of ankyrin repeat domain 49, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD49, Length 3,002 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD49-208ENST00000544253 PIK3C2AO00443 1686 aa8.42□□□□□ -1.06
ANKRD49-208ENST00000544253 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.42□□□□□ -1.06
ANKRD49-208ENST00000544253 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.42□□□□□ -1.06
ANKRD49-208ENST00000544253 BCL9O00512 1426 aa8.42□□□□□ -1.06
ANKRD49-208ENST00000544253 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.42□□□□□ -1.06
ANKRD49-208ENST00000544253 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
ANKRD49-208ENST00000544253 PRAM1Q96QH2 718 aa8.42□□□□□ -1.06
ANKRD49-208ENST00000544253 KRT28Q7Z3Y7 464 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD49-208ENST00000544253 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD49-208ENST00000544253 PARD3Q8TEW0 1356 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD49-208ENST00000544253 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD49-208ENST00000544253 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD49-208ENST00000544253 PRR36Q9H6K5 1346 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD49-208ENST00000544253 TMEM132EQ6IEE7 984 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 SLC24A1O60721 1099 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 RGL3Q3MIN7 710 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 LRRC37A3O60309 1634 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 NUP188Q5SRE5 1749 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 NINLQ9Y2I6 1382 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 QSER1Q2KHR3 1735 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 NFAT5O94916 1531 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 FOXO3O43524 673 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 USP6P35125 1406 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 POGKQ9P215 609 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 SBF2Q86WG5 1849 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 ADAMTS2O95450 1211 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 STK26Q9P289 416 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 COL24A1Q17RW2 1714 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 BARGINQ6ZT62 677 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 CCDC61Q9Y6R9 512 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 USP31Q70CQ4 1352 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 AATKQ6ZMQ8 1374 aa8.34□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa8.34□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 TTC21AQ8NDW8 1320 aa8.34□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 NHSQ6T4R5 1651 aa8.34□□□□□ -1.07
ANKRD49-208ENST00000544253 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 LTN1O94822 1766 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 CASZ1Q86V15 1759 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 CDK19Q9BWU1 502 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 CRB1P82279 1406 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 CD163L1Q9NR16 1453 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 FAM83GA6ND36 823 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 EVC2Q86UK5 1308 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 KIF20BQ96Q89 1820 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 NBPF8Q3BBV2 869 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 ACEP12821 1306 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 PAPPAQ13219 1627 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 CLSPNQ9HAW4 1339 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 KRT27Q7Z3Y8 459 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 SEPT12Q8IYM1 358 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 KIAA0232Q92628 1395 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 MYOM1P52179 1685 aa8.28□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 RGPD5Q99666 1765 aa8.28□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.28□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa8.28□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 OVOS2Q6IE36 1432 aa8.28□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 NLRP13Q86W25 1043 aa8.28□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 CCDC7Q96M83 1385 aa8.27□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.08
ANKRD49-208ENST00000544253 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.27□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.27□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 KCNH5Q8NCM2 988 aa8.27□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa8.27□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 TNS2Q63HR2 1409 aa8.27□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.27□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 RTL1A6NKG5 1358 aa8.26□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 BAG6P46379 1132 aa8.26□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 BTG4Q9NY30 223 aa8.26□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 FAM196AQ6ZSG2 479 aa8.26□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa8.26□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF831Q5JPB2 1677 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 LY75O60449 1722 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 PKD1L3Q7Z443 1732 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 PRDM11Q9NQV5 511 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 NUTM2FA1L443 756 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 NCAPD2Q15021 1401 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms