RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.61■□□□□ 0.89
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PTPRU-209ENST00000526080 MYT1Q01538 1121 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRU-209ENST00000526080 FAM182BQ5T319 152 aa20.59■□□□□ 0.89
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PTPRU-209ENST00000526080 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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PTPRU-209ENST00000526080 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.42■□□□□ 0.86
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PTPRU-209ENST00000526080 UTRNP46939 3433 aa20.41■□□□□ 0.86
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PTPRU-209ENST00000526080 CPDO75976 1380 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRU-209ENST00000526080 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
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PTPRU-209ENST00000526080 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.29■□□□□ 0.84
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PTPRU-209ENST00000526080 CRB1P82279 1406 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTPRU-209ENST00000526080 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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PTPRU-209ENST00000526080 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-209ENST00000526080 COL18A1P39060 1754 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-209ENST00000526080 BCL9O00512 1426 aa20.23■□□□□ 0.83
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PTPRU-209ENST00000526080 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-209ENST00000526080 PIK3C2AO00443 1686 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRU-209ENST00000526080 MYOM1P52179 1685 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRU-209ENST00000526080 USP6P35125 1406 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRU-209ENST00000526080 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRU-209ENST00000526080 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRU-209ENST00000526080 AKAP12Q02952 1782 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRU-209ENST00000526080 DDB1Q16531 1140 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRU-209ENST00000526080 PROM2Q8N271 834 aa20.17■□□□□ 0.82
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