RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC24Q8N4L8 307 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 RDH13Q8NBN7 331 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 E2F4Q16254 413 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 LYPD4Q6UWN0 246 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 BMP2P12643 396 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 VARSP26640 1264 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 GCGRP47871 477 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 PXYLP1Q8TE99 480 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 PTSQ03393 145 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 C6orf118Q5T5N4 469 aa3.68□□□□□ -1.82
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RNU6-162P-201ENST00000516228 LINC00528Q8N1L1 170 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 NEDD1Q8NHV4 660 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 SCO2A0A1W2PP80 73 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPTLC1O15269 473 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 TXKP42681 527 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 DNMT3LQ9UJW3 386 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 ITGA6P23229 1130 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC155Q8N6L0 562 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZFP64Q9NPA5 681 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-162P-201ENST00000516228 TTLL8A6PVC2 850 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 PIK3R2O00459 728 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 SH3BP2P78314 561 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 NR5A1Q13285 461 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 VWA5B2Q8N398 1253 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 MEIOBQ8N635 442 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 CDC14CA4D256 554 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC35F4A4IF30 521 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRBA1A5PL33 1030 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 BCRP11274 1271 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 JUNDP17535 347 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARTNQ5T4W7 220 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 TLL2Q9Y6L7 1015 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 DDX11L8A8MPP1 907 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 FCHSD2O94868 740 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM174AQ8TBP5 190 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 GMCL1Q96IK5 515 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 CDK15Q96Q40 435 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 NUDT12Q9BQG2 462 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 SEMA6BQ9H3T3 888 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 MKL2Q9ULH7 1088 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 MBIPQ9NS73 344 aa3.62□□□□□ -1.83
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RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM161AQ3B820 660 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 FOXR1Q6PIV2 292 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 ITPKCQ96DU7 683 aa3.61□□□□□ -1.83
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RNU6-162P-201ENST00000516228 WDR70Q9NW82 654 aa3.6□□□□□ -1.83
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RNU6-162P-201ENST00000516228 RETREG3Q86VR2 466 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPINT1O43278 529 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 OIP5O43482 229 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 KDM4AO75164 1064 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 MS4A1P11836 297 aa3.56□□□□□ -1.84
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RNU6-162P-201ENST00000516228 COL8A1P27658 744 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 LRP8Q14114 963 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 MCTP1Q6DN14 999 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 BAP1Q92560 729 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 FMNL2Q96PY5 1086 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 FIGNL2A6NMB9 653 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 KCNH2Q12809 1159 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARID5BQ14865 1188 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 CD163Q86VB7 1156 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 ACDQ96AP0 544 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 GRM5P41594 1212 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 MAP2K3P46734 347 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 GRIN2CQ14957 1233 aa3.53□□□□□ -1.84
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