RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 HPS5Q9UPZ3 1129 aa13.45□□□□□ -0.26
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PGGT1B-205ENST00000514178 SCUBE3Q8IX30 993 aa13.44□□□□□ -0.26
PGGT1B-205ENST00000514178 MAP10Q9P2G4 905 aa13.44□□□□□ -0.26
PGGT1B-205ENST00000514178 SOWAHBA6NEL2 793 aa13.43□□□□□ -0.26
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PGGT1B-205ENST00000514178 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa13.43□□□□□ -0.26
PGGT1B-205ENST00000514178 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PGGT1B-205ENST00000514178 NR1I2O75469 434 aa13.42□□□□□ -0.26
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PGGT1B-205ENST00000514178 USP17L4A6NCW7 530 aa13.34□□□□□ -0.27
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PGGT1B-205ENST00000514178 USP17L2Q6R6M4 530 aa13.34□□□□□ -0.27
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PGGT1B-205ENST00000514178 USP17L5A8MUK1 530 aa13.33□□□□□ -0.28
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PGGT1B-205ENST00000514178 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa13.32□□□□□ -0.28
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PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM164Q5U3C3 297 aa13.29□□□□□ -0.28
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PGGT1B-205ENST00000514178 RNF135Q8IUD6 432 aa13.24□□□□□ -0.29
PGGT1B-205ENST00000514178 PHTF2Q8N3S3 785 aa13.24□□□□□ -0.29
PGGT1B-205ENST00000514178 USP17L15C9J2P7 530 aa13.23□□□□□ -0.29
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PGGT1B-205ENST00000514178 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
PGGT1B-205ENST00000514178 TLL1O43897 1013 aa13.21□□□□□ -0.29
PGGT1B-205ENST00000514178 PLPP7Q8NBV4 271 aa13.21□□□□□ -0.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa13.21□□□□□ -0.29
PGGT1B-205ENST00000514178 PTK7Q13308 1070 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC27Q2M243 656 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa13.19□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 RASA1P20936 1047 aa13.19□□□□□ -0.3
PGGT1B-205ENST00000514178 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
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