RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512813.5

CLCN3-208, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLCN3, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-208ENST00000512813 CAPN15O75808 1086 aa14.78□□□□□ -0.04
CLCN3-208ENST00000512813 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.78□□□□□ -0.04
CLCN3-208ENST00000512813 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CLCN3-208ENST00000512813 PRELPP51888 382 aa14.77□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 GPR162Q16538 588 aa14.76□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.76□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 PDE3BQ13370 1112 aa14.75□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.75□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.74□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa14.74□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 TECPR2O15040 1411 aa14.74□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 CLTCL1P53675 1640 aa14.74□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 PLSCR1O15162 318 aa14.73□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 MTFR1LQ9H019 292 aa14.73□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 ATP10DQ9P241 1426 aa14.73□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 ALS2Q96Q42 1657 aa14.72□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.72□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 BARGINQ6ZT62 677 aa14.71□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 ARXQ96QS3 562 aa14.71□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 IFT172Q9UG01 1749 aa14.71□□□□□ -0.05
CLCN3-208ENST00000512813 PEAK1Q9H792 1746 aa14.7□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.7□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.69□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 KIF1BO60333 1816 aa14.69□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 TNS4Q8IZW8 715 aa14.68□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 PRDM11Q9NQV5 511 aa14.68□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 SBF2Q86WG5 1849 aa14.67□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 WAPLQ7Z5K2 1190 aa14.67□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 NUP155O75694 1391 aa14.67□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14.66□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa14.66□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 OVOS2Q6IE36 1432 aa14.66□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.66□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa14.66□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 STK32BQ9NY57 414 aa14.66□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 APLP1P51693 650 aa14.65□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 SLC15A2Q16348 729 aa14.65□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 PROM2Q8N271 834 aa14.65□□□□□ -0.06
CLCN3-208ENST00000512813 ADCY9O60503 1353 aa14.63□□□□□ -0.07
CLCN3-208ENST00000512813 PPLO60437 1756 aa14.63□□□□□ -0.07
CLCN3-208ENST00000512813 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLCN3-208ENST00000512813 STRN4Q9NRL3 753 aa14.63□□□□□ -0.07
CLCN3-208ENST00000512813 USP35Q9P2H5 1018 aa14.63□□□□□ -0.07
CLCN3-208ENST00000512813 SSH2Q76I76 1423 aa14.63□□□□□ -0.07
CLCN3-208ENST00000512813 KIAA0232Q92628 1395 aa14.62□□□□□ -0.07
CLCN3-208ENST00000512813 ABCC11Q96J66 1382 aa14.62□□□□□ -0.07
CLCN3-208ENST00000512813 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CLCN3-208ENST00000512813 ATP7BP35670 1465 aa14.61□□□□□ -0.07
CLCN3-208ENST00000512813 GRIN3BO60391 1043 aa14.6□□□□□ -0.07
CLCN3-208ENST00000512813 TCP11L2Q8N4U5 519 aa14.6□□□□□ -0.07
CLCN3-208ENST00000512813 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa14.6□□□□□ -0.07
CLCN3-208ENST00000512813 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLCN3-208ENST00000512813 STK26Q9P289 416 aa14.59□□□□□ -0.07
CLCN3-208ENST00000512813 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.58□□□□□ -0.07
CLCN3-208ENST00000512813 CHRNA2Q15822 529 aa14.58□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 LRRC37A3O60309 1634 aa14.58□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.58□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.58□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 PAPPAQ13219 1627 aa14.57□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 TXNRD1Q16881 649 aa14.57□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.57□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.57□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.56□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 ROCK1Q13464 1354 aa14.56□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.56□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 WDR90Q96KV7 1748 aa14.55□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 KLHL34Q8N239 644 aa14.55□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 JMYQ8N9B5 988 aa14.55□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.55□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 BCL9O00512 1426 aa14.55□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.55□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 KIF3CO14782 793 aa14.54□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 EVA1CP58658 441 aa14.53□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
CLCN3-208ENST00000512813 SIRT1Q96EB6 747 aa14.52□□□□□ -0.09
CLCN3-208ENST00000512813 PCNTO95613 3336 aa14.52□□□□□ -0.09
CLCN3-208ENST00000512813 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CLCN3-208ENST00000512813 KLRG1Q96E93 195 aa14.51□□□□□ -0.09
CLCN3-208ENST00000512813 POLD1P28340 1107 aa14.5□□□□□ -0.09
CLCN3-208ENST00000512813 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.49□□□□□ -0.09
CLCN3-208ENST00000512813 AKAP12Q02952 1782 aa14.49□□□□□ -0.09
CLCN3-208ENST00000512813 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.49□□□□□ -0.09
CLCN3-208ENST00000512813 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CLCN3-208ENST00000512813 SLC16A10Q8TF71 515 aa14.48□□□□□ -0.09
CLCN3-208ENST00000512813 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.47□□□□□ -0.09
CLCN3-208ENST00000512813 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CLCN3-208ENST00000512813 DDB1Q16531 1140 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.3 ms