RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512673.1

ALYREF-204, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 2

Gene ALYREF, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-204ENST00000512673 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.72■■□□□ 1.39
ALYREF-204ENST00000512673 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.71■■□□□ 1.39
ALYREF-204ENST00000512673 ABCC11Q96J66 1382 aa23.71■■□□□ 1.39
ALYREF-204ENST00000512673 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
ALYREF-204ENST00000512673 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.67■■□□□ 1.38
ALYREF-204ENST00000512673 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
ALYREF-204ENST00000512673 C1QTNF8P60827 252 aa23.66■■□□□ 1.38
ALYREF-204ENST00000512673 STRN4Q9NRL3 753 aa23.66■■□□□ 1.38
ALYREF-204ENST00000512673 USP35Q9P2H5 1018 aa23.66■■□□□ 1.38
ALYREF-204ENST00000512673 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
ALYREF-204ENST00000512673 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
ALYREF-204ENST00000512673 RGL3Q3MIN7 710 aa23.65■■□□□ 1.38
ALYREF-204ENST00000512673 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.65■■□□□ 1.38
ALYREF-204ENST00000512673 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.64■■□□□ 1.37
ALYREF-204ENST00000512673 CHRNA2Q15822 529 aa23.63■■□□□ 1.37
ALYREF-204ENST00000512673 ALS2Q96Q42 1657 aa23.63■■□□□ 1.37
ALYREF-204ENST00000512673 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-204ENST00000512673 PDE3BQ13370 1112 aa23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-204ENST00000512673 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.59■■□□□ 1.37
ALYREF-204ENST00000512673 MYOM1P52179 1685 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-204ENST00000512673 KIAA0232Q92628 1395 aa23.57■■□□□ 1.36
ALYREF-204ENST00000512673 ZBTB7AO95365 584 aa23.57■■□□□ 1.36
ALYREF-204ENST00000512673 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
ALYREF-204ENST00000512673 PRAM1Q96QH2 718 aa23.56■■□□□ 1.36
ALYREF-204ENST00000512673 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ALYREF-204ENST00000512673 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ALYREF-204ENST00000512673 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ALYREF-204ENST00000512673 PIK3C2GO75747 1445 aa23.55■■□□□ 1.36
ALYREF-204ENST00000512673 CASZ1Q86V15 1759 aa23.55■■□□□ 1.36
ALYREF-204ENST00000512673 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.54■■□□□ 1.36
ALYREF-204ENST00000512673 CEP350Q5VT06 3117 aa23.54■■□□□ 1.36
ALYREF-204ENST00000512673 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ALYREF-204ENST00000512673 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
ALYREF-204ENST00000512673 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ALYREF-204ENST00000512673 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
ALYREF-204ENST00000512673 SIRT1Q96EB6 747 aa23.51■■□□□ 1.35
ALYREF-204ENST00000512673 CHD4Q14839 1912 aa23.51■■□□□ 1.35
ALYREF-204ENST00000512673 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.51■■□□□ 1.35
ALYREF-204ENST00000512673 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.5■■□□□ 1.35
ALYREF-204ENST00000512673 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.5■■□□□ 1.35
ALYREF-204ENST00000512673 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.5■■□□□ 1.35
ALYREF-204ENST00000512673 PTGER2P43116 358 aa23.49■■□□□ 1.35
ALYREF-204ENST00000512673 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
ALYREF-204ENST00000512673 EVA1CP58658 441 aa23.48■■□□□ 1.35
ALYREF-204ENST00000512673 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.48■■□□□ 1.35
ALYREF-204ENST00000512673 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ALYREF-204ENST00000512673 BARGINQ6ZT62 677 aa23.48■■□□□ 1.35
ALYREF-204ENST00000512673 SYT17Q9BSW7 474 aa23.48■■□□□ 1.35
ALYREF-204ENST00000512673 SSH2Q76I76 1423 aa23.48■■□□□ 1.35
ALYREF-204ENST00000512673 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.47■■□□□ 1.35
ALYREF-204ENST00000512673 POGKQ9P215 609 aa23.47■■□□□ 1.35
ALYREF-204ENST00000512673 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.46■■□□□ 1.35
ALYREF-204ENST00000512673 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
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ALYREF-204ENST00000512673 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ALYREF-204ENST00000512673 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.44■■□□□ 1.34
ALYREF-204ENST00000512673 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ALYREF-204ENST00000512673 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ALYREF-204ENST00000512673 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ALYREF-204ENST00000512673 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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ALYREF-204ENST00000512673 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-204ENST00000512673 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-204ENST00000512673 PEAK1Q9H792 1746 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-204ENST00000512673 PLSCR1O15162 318 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-204ENST00000512673 SBF2Q86WG5 1849 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-204ENST00000512673 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-204ENST00000512673 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-204ENST00000512673 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-204ENST00000512673 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-204ENST00000512673 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-204ENST00000512673 DLC1Q96QB1 1528 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-204ENST00000512673 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-204ENST00000512673 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.32■■□□□ 1.32
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ALYREF-204ENST00000512673 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ALYREF-204ENST00000512673 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.31■■□□□ 1.32
ALYREF-204ENST00000512673 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ALYREF-204ENST00000512673 GPR162Q16538 588 aa23.3■■□□□ 1.32
ALYREF-204ENST00000512673 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ALYREF-204ENST00000512673 LRRC37A3O60309 1634 aa23.3■■□□□ 1.32
ALYREF-204ENST00000512673 SLC15A2Q16348 729 aa23.29■■□□□ 1.32
ALYREF-204ENST00000512673 MTFR1LQ9H019 292 aa23.29■■□□□ 1.32
ALYREF-204ENST00000512673 ARXQ96QS3 562 aa23.28■■□□□ 1.32
ALYREF-204ENST00000512673 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.27■■□□□ 1.32
ALYREF-204ENST00000512673 TXNRD1Q16881 649 aa23.27■■□□□ 1.32
ALYREF-204ENST00000512673 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
ALYREF-204ENST00000512673 ATP7BP35670 1465 aa23.27■■□□□ 1.32
ALYREF-204ENST00000512673 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
ALYREF-204ENST00000512673 DDB1Q16531 1140 aa23.26■■□□□ 1.31
ALYREF-204ENST00000512673 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.25■■□□□ 1.31
ALYREF-204ENST00000512673 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
ALYREF-204ENST00000512673 KLHL34Q8N239 644 aa23.25■■□□□ 1.31
ALYREF-204ENST00000512673 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ALYREF-204ENST00000512673 ADGRB1O14514 1584 aa23.23■■□□□ 1.31
ALYREF-204ENST00000512673 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ALYREF-204ENST00000512673 CRB1P82279 1406 aa23.23■■□□□ 1.31
ALYREF-204ENST00000512673 ITSN1Q15811 1721 aa23.22■■□□□ 1.31
ALYREF-204ENST00000512673 ABTB2Q8N961 1025 aa23.22■■□□□ 1.31
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