RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HERC3-210ENST00000512194 RNF40O75150 1001 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-210ENST00000512194 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HERC3-210ENST00000512194 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HERC3-210ENST00000512194 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HERC3-210ENST00000512194 UACAQ9BZF9 1416 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-210ENST00000512194 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-210ENST00000512194 SOCS7O14512 581 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-210ENST00000512194 ATP6V1AP38606 617 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-210ENST00000512194 FUT2Q10981 343 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-210ENST00000512194 FBXO41Q8TF61 875 aa11.47□□□□□ -0.57
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HERC3-210ENST00000512194 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.45□□□□□ -0.58
HERC3-210ENST00000512194 GOLGA8CPA6NN73 597 aa11.45□□□□□ -0.58
HERC3-210ENST00000512194 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
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HERC3-210ENST00000512194 CABLES1Q8TDN4 633 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-210ENST00000512194 CLUAP1Q96AJ1 413 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-210ENST00000512194 SNRKQ9NRH2 765 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-210ENST00000512194 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
HERC3-210ENST00000512194 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-210ENST00000512194 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.42□□□□□ -0.58
HERC3-210ENST00000512194 SOWAHBA6NEL2 793 aa11.42□□□□□ -0.58
HERC3-210ENST00000512194 APBB1O00213 710 aa11.42□□□□□ -0.58
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HERC3-210ENST00000512194 HLA-CQ95604 372 aa11.42□□□□□ -0.58
HERC3-210ENST00000512194 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-210ENST00000512194 AP1G2O75843 785 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-210ENST00000512194 ARXQ96QS3 562 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-210ENST00000512194 TRAK2O60296 914 aa11.4□□□□□ -0.58
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HERC3-210ENST00000512194 MTMR14Q8NCE2 650 aa11.39□□□□□ -0.59
HERC3-210ENST00000512194 PRM3Q9NNZ6 103 aa11.39□□□□□ -0.59
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HERC3-210ENST00000512194 C6orf229H3BNL8 230 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-210ENST00000512194 MORN1Q5T089 497 aa11.38□□□□□ -0.59
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HERC3-210ENST00000512194 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-210ENST00000512194 MADDQ8WXG6 1647 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-210ENST00000512194 BCORL1Q5H9F3 1711 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-210ENST00000512194 USP17L8P0C7I0 530 aa11.37□□□□□ -0.59
HERC3-210ENST00000512194 Q3C1V9 767 aa11.37□□□□□ -0.59
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HERC3-210ENST00000512194 POM121Q96HA1 1249 aa11.37□□□□□ -0.59
HERC3-210ENST00000512194 HPS5Q9UPZ3 1129 aa11.37□□□□□ -0.59
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HERC3-210ENST00000512194 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-210ENST00000512194 CEP162Q5TB80 1403 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-210ENST00000512194 BCAMP50895 628 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-210ENST00000512194 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-210ENST00000512194 CLIP1P30622 1438 aa11.34□□□□□ -0.59
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HERC3-210ENST00000512194 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HERC3-210ENST00000512194 RETREG3Q86VR2 466 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-210ENST00000512194 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
HERC3-210ENST00000512194 ARAP3Q8WWN8 1544 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-210ENST00000512194 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-210ENST00000512194 APLP1P51693 650 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-210ENST00000512194 CTDSPL2Q05D32 466 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-210ENST00000512194 WWC1Q8IX03 1113 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC3-210ENST00000512194 PRR7Q8TB68 274 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC3-210ENST00000512194 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
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HERC3-210ENST00000512194 DESI1Q6ICB0 168 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-210ENST00000512194 TSC1Q92574 1164 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-210ENST00000512194 GDPD2Q9HCC8 539 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-210ENST00000512194 ABCA9Q8IUA7 1624 aa11.3□□□□□ -0.6
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HERC3-210ENST00000512194 THSD4Q6ZMP0 1018 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-210ENST00000512194 NYAP1Q6ZVC0 841 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-210ENST00000512194 ILDR2Q71H61 639 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-210ENST00000512194 HOMEZQ8IX15 550 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-210ENST00000512194 SCUBE3Q8IX30 993 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-210ENST00000512194 WBP1LQ9NX94 342 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-210ENST00000512194 RICTORQ6R327 1708 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-210ENST00000512194 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
HERC3-210ENST00000512194 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
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