RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 PIK3C2AO00443 1686 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-218ENST00000511185 SLIT2O94813 1529 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP2-218ENST00000511185 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SH3BP2-218ENST00000511185 RGS12O14924 1447 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP2-218ENST00000511185 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP2-218ENST00000511185 ATRNO75882 1429 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-218ENST00000511185 GLI3P10071 1580 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP2-218ENST00000511185 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP2-218ENST00000511185 EVC2Q86UK5 1308 aa26.64■■□□□ 1.85
SH3BP2-218ENST00000511185 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SH3BP2-218ENST00000511185 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SH3BP2-218ENST00000511185 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SH3BP2-218ENST00000511185 USP21Q9UK80 565 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP2-218ENST00000511185 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.61■■□□□ 1.85
SH3BP2-218ENST00000511185 USP6P35125 1406 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BP2-218ENST00000511185 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SH3BP2-218ENST00000511185 RXRBP28702 533 aa26.59■■□□□ 1.85
SH3BP2-218ENST00000511185 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SH3BP2-218ENST00000511185 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.59■■□□□ 1.85
SH3BP2-218ENST00000511185 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-218ENST00000511185 CABP1Q9NZU7 370 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-218ENST00000511185 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP2-218ENST00000511185 SSH2Q76I76 1423 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP2-218ENST00000511185 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP2-218ENST00000511185 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-218ENST00000511185 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-218ENST00000511185 USP47Q96K76 1375 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-218ENST00000511185 USP54Q70EL1 1684 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-218ENST00000511185 SLIT3O75094 1523 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-218ENST00000511185 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-218ENST00000511185 MYOM1P52179 1685 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-218ENST00000511185 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-218ENST00000511185 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-218ENST00000511185 TESK2Q96S53 571 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-218ENST00000511185 USP19O94966 1318 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM83GA6ND36 823 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-218ENST00000511185 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA0232Q92628 1395 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-218ENST00000511185 RGPD5Q99666 1765 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-218ENST00000511185 ABTB2Q8N961 1025 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-218ENST00000511185 EP400Q96L91 3159 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-218ENST00000511185 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-218ENST00000511185 COL18A1P39060 1754 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-218ENST00000511185 LTN1O94822 1766 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-218ENST00000511185 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-218ENST00000511185 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-218ENST00000511185 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SH3BP2-218ENST00000511185 BTG4Q9NY30 223 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP2-218ENST00000511185 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-218ENST00000511185 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-218ENST00000511185 CHRNA2Q15822 529 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-218ENST00000511185 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PP64 1363 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-218ENST00000511185 NFAT5O94916 1531 aa26.4■■□□□ 1.82
SH3BP2-218ENST00000511185 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.4■■□□□ 1.82
SH3BP2-218ENST00000511185 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS72Q15906 364 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-218ENST00000511185 CPDO75976 1380 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-218ENST00000511185 TMC1Q8TDI8 760 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-218ENST00000511185 NLRP13Q86W25 1043 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-218ENST00000511185 NLRP6P59044 892 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
SH3BP2-218ENST00000511185 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
SH3BP2-218ENST00000511185 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.33■■□□□ 1.81
SH3BP2-218ENST00000511185 GCP02774 474 aa26.32■■□□□ 1.8
SH3BP2-218ENST00000511185 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.32■■□□□ 1.8
SH3BP2-218ENST00000511185 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.32■■□□□ 1.8
SH3BP2-218ENST00000511185 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2-218ENST00000511185 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-218ENST00000511185 NME9Q86XW9 330 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-218ENST00000511185 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-218ENST00000511185 STRN4Q9NRL3 753 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-218ENST00000511185 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-218ENST00000511185 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-218ENST00000511185 SOX12O15370 315 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-218ENST00000511185 TMF1P82094 1093 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-218ENST00000511185 USP31Q70CQ4 1352 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-218ENST00000511185 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-218ENST00000511185 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-218ENST00000511185 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC37A3O60309 1634 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCC6O95255 1503 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-218ENST00000511185 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-218ENST00000511185 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-218ENST00000511185 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-218ENST00000511185 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-218ENST00000511185 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
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