RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 SSFA2P28290 1259 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 SLC4A3P48751 1232 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 MORN1Q5T089 497 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 FAM196BA6NMK8 535 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 RNF40O75150 1001 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 POTEB2H3BUK9 544 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 PTK7Q13308 1070 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 LHX8Q68G74 356 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 SERPINB4P48594 390 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 NCOA4Q13772 614 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 MAP10Q9P2G4 905 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 Q3C1V9 767 aa8□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 RASA1P20936 1047 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 SCNN1AP37088 669 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 ARHGAP33O14559 1287 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 ERCC3P19447 782 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 ATP2B4P23634 1241 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 KCNH2Q12809 1159 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
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HERC3-209ENST00000504994 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 USP35Q9P2H5 1018 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-209ENST00000504994 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.96□□□□□ -1.14
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HERC3-209ENST00000504994 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.96□□□□□ -1.14
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HERC3-209ENST00000504994 PTPRNQ16849 979 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 BRICD5Q6PL45 260 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 RNF135Q8IUD6 432 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 JUNDP17535 347 aa7.94□□□□□ -1.14
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HERC3-209ENST00000504994 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
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HERC3-209ENST00000504994 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 OGFOD1Q8N543 542 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 SIRT1Q96EB6 747 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 THAP11Q96EK4 314 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.93□□□□□ -1.14
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HERC3-209ENST00000504994 GIPC2Q8TF65 315 aa7.92□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 NBPF3Q9H094 633 aa7.92□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 DKK1O94907 266 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 PTK2Q05397 1052 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 EML3Q32P44 896 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 PRMT3O60678 531 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 LRCH3Q96II8 777 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
HERC3-209ENST00000504994 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
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