RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
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KCNQ1-205ENST00000496887 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.88■■□□□ 1.41
KCNQ1-205ENST00000496887 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
KCNQ1-205ENST00000496887 RXRBP28702 533 aa23.86■■□□□ 1.41
KCNQ1-205ENST00000496887 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.85■■□□□ 1.41
KCNQ1-205ENST00000496887 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.84■■□□□ 1.41
KCNQ1-205ENST00000496887 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.84■■□□□ 1.41
KCNQ1-205ENST00000496887 AKAP12Q02952 1782 aa23.83■■□□□ 1.41
KCNQ1-205ENST00000496887 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.83■■□□□ 1.41
KCNQ1-205ENST00000496887 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.83■■□□□ 1.4
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KCNQ1-205ENST00000496887 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
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KCNQ1-205ENST00000496887 FAM83GA6ND36 823 aa23.78■■□□□ 1.4
KCNQ1-205ENST00000496887 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
KCNQ1-205ENST00000496887 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.77■■□□□ 1.4
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
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KCNQ1-205ENST00000496887 PIK3C2AO00443 1686 aa23.75■■□□□ 1.39
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KCNQ1-205ENST00000496887 SLC24A1O60721 1099 aa23.74■■□□□ 1.39
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KCNQ1-205ENST00000496887 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.72■■□□□ 1.39
KCNQ1-205ENST00000496887 USP19O94966 1318 aa23.72■■□□□ 1.39
KCNQ1-205ENST00000496887 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.72■■□□□ 1.39
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KCNQ1-205ENST00000496887 KIAA0232Q92628 1395 aa23.71■■□□□ 1.39
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KCNQ1-205ENST00000496887 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNQ1-205ENST00000496887 COL18A1P39060 1754 aa23.55■■□□□ 1.36
KCNQ1-205ENST00000496887 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.55■■□□□ 1.36
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KCNQ1-205ENST00000496887 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
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KCNQ1-205ENST00000496887 RGPD5Q99666 1765 aa23.52■■□□□ 1.36
KCNQ1-205ENST00000496887 EP400Q96L91 3159 aa23.52■■□□□ 1.36
KCNQ1-205ENST00000496887 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.52■■□□□ 1.36
KCNQ1-205ENST00000496887 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
KCNQ1-205ENST00000496887 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.51■■□□□ 1.35
KCNQ1-205ENST00000496887 A0A0G2JS52 829 aa23.5■■□□□ 1.35
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KCNQ1-205ENST00000496887 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
KCNQ1-205ENST00000496887 LTN1O94822 1766 aa23.5■■□□□ 1.35
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