RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495280.5

PRRX1-205, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene PRRX1, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-205ENST00000495280 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-205ENST00000495280 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-205ENST00000495280 DACH1Q9UI36 760 aa8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-205ENST00000495280 DESI1Q6ICB0 168 aa8.39□□□□□ -1.07
PRRX1-205ENST00000495280 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-205ENST00000495280 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-205ENST00000495280 LYPD8Q6UX82 237 aa8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-205ENST00000495280 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-205ENST00000495280 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-205ENST00000495280 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-205ENST00000495280 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PRRX1-205ENST00000495280 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.37□□□□□ -1.07
PRRX1-205ENST00000495280 ABCC9O60706 1549 aa8.36□□□□□ -1.07
PRRX1-205ENST00000495280 AVPP01185 164 aa8.36□□□□□ -1.07
PRRX1-205ENST00000495280 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PRRX1-205ENST00000495280 PTPRNQ16849 979 aa8.35□□□□□ -1.07
PRRX1-205ENST00000495280 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.34□□□□□ -1.07
PRRX1-205ENST00000495280 CTHP32929 405 aa8.34□□□□□ -1.07
PRRX1-205ENST00000495280 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.34□□□□□ -1.07
PRRX1-205ENST00000495280 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.34□□□□□ -1.07
PRRX1-205ENST00000495280 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.33□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.33□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 KCNH2Q12809 1159 aa8.32□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 USP17L8P0C7I0 530 aa8.31□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.31□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 BANK1Q8NDB2 785 aa8.31□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.31□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 AXIN1O15169 862 aa8.3□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 SNRKQ9NRH2 765 aa8.3□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 MAP10Q9P2G4 905 aa8.3□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 NR6A1Q15406 480 aa8.28□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.28□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.28□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PRRX1-205ENST00000495280 RPIAP49247 311 aa8.27□□□□□ -1.09
PRRX1-205ENST00000495280 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.27□□□□□ -1.09
PRRX1-205ENST00000495280 BAP1Q92560 729 aa8.26□□□□□ -1.09
PRRX1-205ENST00000495280 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PRRX1-205ENST00000495280 TRIM32Q13049 653 aa8.25□□□□□ -1.09
PRRX1-205ENST00000495280 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.25□□□□□ -1.09
PRRX1-205ENST00000495280 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.25□□□□□ -1.09
PRRX1-205ENST00000495280 FOXC1Q12948 553 aa8.23□□□□□ -1.09
PRRX1-205ENST00000495280 LINC01559Q495D7 138 aa8.23□□□□□ -1.09
PRRX1-205ENST00000495280 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PRRX1-205ENST00000495280 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.23□□□□□ -1.09
PRRX1-205ENST00000495280 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.22□□□□□ -1.09
PRRX1-205ENST00000495280 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 SH3BP2P78314 561 aa8.21□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 FLIIQ13045 1269 aa8.21□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 MCM6Q14566 821 aa8.21□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.21□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.21□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 SKOR1P84550 965 aa8.2□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 TRIM47Q96LD4 638 aa8.2□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 APBB1O00213 710 aa8.19□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 AGERQ15109 404 aa8.19□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 ZNF511Q8NB15 262 aa8.19□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 PNMA1Q8ND90 353 aa8.19□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 SOCS7O14512 581 aa8.18□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 WNT7BP56706 349 aa8.18□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 NBPF14Q5TI25 921 aa8.18□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 CYP4X1Q8N118 509 aa8.18□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 FOXJ1Q92949 421 aa8.18□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.18□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.18□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 SENP2Q9HC62 589 aa8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 GDPD2Q9HCC8 539 aa8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.16□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 WNT7AO00755 349 aa8.15□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.15□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.15□□□□□ -1.1
PRRX1-205ENST00000495280 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-205ENST00000495280 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-205ENST00000495280 GMPRP36959 345 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-205ENST00000495280 ABL2P42684 1182 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-205ENST00000495280 PTK2Q05397 1052 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-205ENST00000495280 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-205ENST00000495280 POM121Q96HA1 1249 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-205ENST00000495280 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-205ENST00000495280 COG6Q9Y2V7 657 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-205ENST00000495280 RAD21O60216 631 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-205ENST00000495280 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-205ENST00000495280 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-205ENST00000495280 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-205ENST00000495280 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-205ENST00000495280 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.12□□□□□ -1.11
PRRX1-205ENST00000495280 ZBTB33Q86T24 672 aa8.12□□□□□ -1.11
PRRX1-205ENST00000495280 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms