RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494095.5

TNNT2-222, Transcript of troponin T2, cardiac type, human

TSL 5

Gene TNNT2, Length 3,014 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNT2-222	ENST00000494095	PDE3B	Q13370	1112 aa		15.1	■□□□□ 0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		15.1	■□□□□ 0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	SOCS7	O14512	581 aa		15.1	■□□□□ 0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		15.1	■□□□□ 0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		15.1	■□□□□ 0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	15.09	■□□□□ 0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	TAF3	Q5VWG9	929 aa		15.09	■□□□□ 0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		15.09	■□□□□ 0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		15.09	■□□□□ 0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	IGHD	P01880	384 aa		15.09	■□□□□ 0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	15.09	■□□□□ 0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		15.08	■□□□□ 0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	15.08	■□□□□ 0
TNNT2-222	ENST00000494095	KCNJ4	P48050	445 aa		15.08	■□□□□ 0
TNNT2-222	ENST00000494095	CERK	Q8TCT0	537 aa		15.08	■□□□□ 0
TNNT2-222	ENST00000494095	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		15.07	■□□□□ 0
TNNT2-222	ENST00000494095	TRPM2	O94759	1503 aa		15.07	■□□□□ 0
TNNT2-222	ENST00000494095	C3	P01024	1663 aa		15.07	■□□□□ 0
TNNT2-222	ENST00000494095	NPAT	Q14207	1427 aa		15.07	■□□□□ 0
TNNT2-222	ENST00000494095	NGEF	Q8N5V2	710 aa		15.06	■□□□□ 0
TNNT2-222	ENST00000494095	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
TNNT2-222	ENST00000494095	MLEC	Q14165	292 aa		15.06	■□□□□ 0
TNNT2-222	ENST00000494095	NOS1	P29475	1434 aa		15.05	■□□□□ -0
TNNT2-222	ENST00000494095	PKD2	Q13563	968 aa		15.05	■□□□□ -0
TNNT2-222	ENST00000494095	ERVK-7	P63135	1459 aa		15.04	■□□□□ -0
TNNT2-222	ENST00000494095	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	15.04	■□□□□ -0
TNNT2-222	ENST00000494095	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		15.04	■□□□□ -0
TNNT2-222	ENST00000494095	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
TNNT2-222	ENST00000494095	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		15.04	■□□□□ -0
TNNT2-222	ENST00000494095	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	15.04	■□□□□ -0
TNNT2-222	ENST00000494095	ZMYM3	Q14202	1370 aa		15.04	■□□□□ -0
TNNT2-222	ENST00000494095	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
TNNT2-222	ENST00000494095	CAPN2	P17655	700 aa		15.03	■□□□□ -0
TNNT2-222	ENST00000494095	PIK3C2B	O00750	1634 aa		15.02	■□□□□ -0
TNNT2-222	ENST00000494095	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		15.02	■□□□□ -0
TNNT2-222	ENST00000494095	HS1BP3	Q53T59	392 aa		15.02	■□□□□ -0
TNNT2-222	ENST00000494095	DDIT3	P35638	169 aa		15.02	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	15.02	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	SYNM	O15061	1565 aa		15.02	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	SOX12	O15370	315 aa		15.01	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	SLC20A2	Q08357	652 aa		15.01	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		15.01	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		15.01	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		15.01	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	PLA2R1	Q13018	1463 aa		15.01	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	15	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	CLTCL1	P53675	1640 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	RBSN	Q9H1K0	784 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	PSEN1	P49768	467 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	MMP14	P50281	582 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	CNPY4	Q8N129	248 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TNNT2-222	ENST00000494095	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	TNR	Q92752	1358 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	14.94	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	KIF1B	O60333	1816 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	PRR29	P0C7W0	189 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	ADGRB3	O60242	1522 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	SLFN14	P0C7P3	912 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	TULP2	O00295	520 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	MCM5	P33992	734 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	14.9	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	GBP4	Q96PP9	640 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TNNT2-222	ENST00000494095	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
TNNT2-222	ENST00000494095	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TNNT2-222	ENST00000494095	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TNNT2-222	ENST00000494095	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
TNNT2-222	ENST00000494095	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TNNT2-222	ENST00000494095	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TNNT2-222	ENST00000494095	USP47	Q96K76	1375 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TNNT2-222	ENST00000494095	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
TNNT2-222	ENST00000494095	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
TNNT2-222	ENST00000494095	RALBP1	Q15311	655 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TNNT2-222	ENST00000494095	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03

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